口腔囊肿以手术治疗效果较好，其他的像激光、微波热凝、冷冻或局部注射药物也能治疗，但容易复发。因为囊肿周围往往有肿大的腺疱，在手术时需要一并切除，以免术后复发。
对腱鞘囊肿多数不会造成明显症状，无需特别处理，主动多加注意休息即可，切忌重复推拿按摩局部。
若腱鞘囊肿渐大，局部有疼痛表现，甚至有血管神经性压迫，需积极手术。由于肌腱囊性增生是一种自身免疫性疾病，因此不能单纯用药物来控制病情发展，应及时到医院就诊检查确诊后再选择适当的方法治疗。
日常生活中加强对身体各部位的护理工作，预防和缓解因外伤等原因造成的损伤。生活上要养成良好的生活习惯，早睡早起，保证充足的睡眠时间。
肌腱囊肿可保守治疗，也可以手术进行治疗。
肌腱囊肿又称为腱鞘囊肿，指肌腱腱鞘或关节处的韧带发生劳损性炎症，引起局部组织膜下积液，积液量渐多，可形成囊肿。腱鞘炎主要是因为长期的紧张劳累以及不良生活方式等因素造成。腱鞘囊肿可局部压揉，有时可将积液捏碎吸收囊壁粘连即可。如囊肿较大，不只影响美观，也会带来痛苦，就必须考虑手术切除。
腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。
精囊囊肿如果比较小，症状比较轻可以选择保守治疗为主，可以定期地按摩定期随访，如果囊肿大于2.5厘米，症状比较明显，可以考虑手术治疗，可以选择经会阴引流囊肿，另外也可以选择微创手术。
附睾囊肿是可以通过手术来进行治疗的，当然也可以通过药物来进行治疗，手术的效果是比较比药物治疗效果要好的多。药物治疗的效果是比较慢一些。一定要去医院的男科进行相关检查，明确病情后再进行进一步的治疗。在治疗过程中不能进行性生活。要积极配合。多注意休息。
