复发性口腔溃疡发病原因除了口腔感染以外，还与自身免疫功能紊乱有关，所以治疗除了控制感染，还应该服用中药调理免疫功能，常用炙甘草汤加减治疗。中西医结合治疗，合理科学饮食，补充维生素和微量元素，注意口腔卫生，养成良好的生活习惯。
口腔溃疡的问题，在西医的角度上，考虑到是因为维生素的缺乏引起的，但补充维生素的治疗效果不佳，所以建议中药调理为基本。可与西药联合使用，控制症状能更快的康复。
是用庆大霉素注射液含漱，由于本药没有讨厌的口味，仅仅有略微有一点酸味，且口服无吸收。通过中药调理来增强体质，能从根本上消除复发，以治本为主，疗效最好，需更高层次中医调理。中药调理即能解决溃疡上火"的问题，还能调理和改善体质，彻底改变这类易上火体质。
治疗复发性口腔溃疡采取全方位数字自动分析仪，口腔，细菌培养，免疫检查这些来明确病因，针对性的治疗的，主要是因为免疫失衡引起的，要从中医角度去提升自身免疫力，先要找准病因，然后再针对性对因施治。
复发性口腔溃疡吃维生素b、c等进行治疗，可能好得快。
复发性口腔溃疡应以根除病源、强化体质、辨证论治。在临床上，应该采取综合疗法、局部疗法、中医疗法、生理学疗法和心理学疗法。吃维生素b、c可以增强身体的免疫力，促进胃粘膜的修复。如果疼痛明显，溃疡多，间隔时间较长，可以选择免疫调整的药物，比如左旋咪唑、转移因子、胸腺素等，还可以口服强的松。
对于口腔溃疡，中医要对症治疗，调节免疫力平衡，提高机体自身免疫力是治疗疾病的关键所在。中西医结合辨证施治依据个人体质所独特配制的纯中药方剂，通过内外兼治，提高免疫力，筑起人体的防预屏障，从而有效的抵御细菌和病毒侵入，发挥对细胞免疫功能的调节作用，增加免疫球蛋白的数量，平衡五脏六腑的功能，提高机体自身免疫力，从源根上有效治疗口腔溃疡。
复发性口腔溃疡是一种以周期性反复发作为特点的口腔粘膜局限性溃疡损害，可发生于口腔粘膜的任何部位，以唇、颊、舌部多见，严重者可以波及咽部粘膜。中药治疗口腔溃疡的疗效较为确切，还可以口腔内外用药物治疗。不要吃辛辣发物。