脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为精神方面异常。有不同程度的肢体运动障碍、智力障碍、失语、眼球麻痹、吞咽困难等后遗症。随着病情的恶化，会导致压迫神经，出现了脑活动不正常的现象。
主要是症状如发热,全身酸痛,头晕头痛,脑膜刺激症,有时可有喷射性呕吐,严重者有意识障碍如嗜睡,昏迷等,属于较严重的病症。脑炎是一种娇嫩的脑膜或脑脊膜被感染的疾病。
痴呆、记忆力及理解减退、智力低下、表情淡漠、眼神呆滞、哭笑无常、攻击性行为、易激惹、还有失语、语言迟钝、瘫痪、吞咽困难、视神经萎缩、耳聋、癫痫等神经系统损害；兴奋多动等精神状态及认知功能异常。
脑炎后遗症可能会出现失眠多梦，也有可能会出现癫痫的情况，也有可能会出现乏力，或者是精神状态不好，这段时间一定要注意劳逸结合，不要太过劳累，每天睡够8个小时。
临床脑炎后遗症以继发癫痫，脑神经损伤，头痛，记忆力减退，失眠等常见，较轻后遗症，包括行为问题、单侧听力丧失、学习困难、肌张力减低、复视。还包括意识障碍、双侧听力丧失、视力障碍、运动障碍、脑积水。
脑炎后遗症会引起精神异常，其中表现为兴奋多语、烦躁，行为怪异，有的患者还可能导致严重的失眠，甚至会产生幻想，或表情冷淡、活动量减少、食欲减退、有的还会出现记忆力衰退、大小便失禁等。