小儿脑炎初期主要表现为发烧、恶心、呕吐、拉肚子、食欲不振、啼哭等。
小儿脑炎，因小儿年龄尚轻，不能充分的表现自身的不舒服，有延误病情，治疗或诊断不及时。小儿脑炎要密切关注孩子的精神状态，一旦出现不正常要马上到正规的医疗机构进行检查。通过对儿童的临床表现和体征进行相应的辅助检测，及早发现和处理，以防止儿童的神经后遗症。
脑炎初期症状多以高热、头痛、躯体疼痛、呕吐、昏迷、晕厥等为主。
随着病情加重出现意识障碍或抽搐等并发症时，会有不同程度的发热以及其他相关症状。因此，若伴随上述病症，那建议还是该检查下血常规了，如白细胞不正常，可口服部分退烧药或抗病毒药物，有助于缓解及治疗，同时，提出要重视合理膳食，确保有充足的热量，添加一些蛋白质、维生素等食品。
脑炎最主要的早期症状是发热，老百姓都知道烧出来脑炎了，其实不是这样的，热是脑炎最早期的症状，尤其是顽固性的高热，进一步是高热伴随了脑功能的异常，如抽风、癫痫急性发作或者昏迷、颅内压增高、前囟鼓的比较高。
结核性脑膜炎的早期表现是儿童精神状态的变化，如烦躁和哭泣;精神停滞;不喜欢游戏;也可能有低烧，食欲不振，呕吐，睡眠不安，减肥表现。由化脓性细菌引起的脑膜炎症，发热，头痛，呕吐和烦躁等症状是主要表现。神经系统检查和脑脊液检查异常。由于孩子的抵抗力较弱，血脑屏障的发育并不完美，细菌很容易进入大脑的神经系统。
小儿脑炎多见于病毒性脑炎。病毒性脑炎是一种由各种病毒导致的颅内急性炎症，这种炎症主要累及大脑实质，一般都是病程自限性的。儿童脑炎发病迅速，其临床表现与脑实质的病变部位、范围、严重程度有关，以发烧、反复抽搐发作、意识障碍、颅内压升高等为主要特征。当大脑损伤以额叶底部为主时，儿童的颞叶边缘系统多以精神和情感障碍为主。