目前认为特发性癫痫综合征大多数具有单基因遗传。良性家族性新生儿癫痫是常染色体显性遗传，存在遗传异质性，家系研究表明，良性家族性婴儿癫痫基因定位于19号染色体短臂。
发病原因是，遗传性，并不一定代代遗传，后天性的，难产出现缺氧缺血性脑病的情况，脑炎后遗症、脑肿瘤、颅脑外伤及脑血管病如脑出血或者脑梗塞的后遗症，还有部分脑血管畸形的病人等。
通常情况下，肌阵挛性癫痫是皮质发育障碍、肿瘤、中枢神经系统感染等原因引起的。
1、皮质发育异常：神经元异位症、局部皮质发育不良是皮质发育异常的主要表现。前驱神经元的运动受到阻碍，无法形成必要的突触连接，从而在局部区域内产生神经网络，从而诱发癫痫。
2、肿瘤：颅内肿瘤可以导致肌阵挛性癫痫的发作，而颅外肿瘤可以通过转移或副肿瘤综合征来导致癫痫反复发作。流行病学研究表明，4%的癫痫病是由肿瘤引起的。在脑瘤病人中，有35%的人患有癫痫病。
3、中枢神经系统感染：结核性脑膜炎、神经梅毒、病毒性脑炎等均可继发于中枢神经系统感染。
一般情况下，儿童失神癫痫可能是遗传、先天性发育不全等原因引起的。具体内容如下：
1.遗传：如果儿童的直系亲属存在失神癫痫的情况，儿童可能携带有疾病基因，出现失神癫痫的概率较高。
2.先天性发育不全：儿童在出生前遭受感染、药物刺激等因素影响，可导致先天性发育不全，两侧大脑半球同步放电，可引发失神癫痫的病症。
继发性癫痫要从大类分，首先最常见于脑部疾病，脑的炎症、脑血管病、脑部肿瘤、脑部先天性异常，以及脑部退行性病变，所有脑部疾病都有可能导致癫痫。还有全身疾病，分为内分泌疾病、电解质紊乱疾病、自体免疫性疾病、炎性疾病。只要人体有变化，脑子就会受人体所有变化的影响，有可能出现癫痫，包括继发性癫痫，有时精神异常也会出现癫痫。所以继发性癫痫的原因很多，一定要在医生的帮助下把病因找到，对症治疗。
形成癫痫病的原因有很多，比如：遗传因素、脑外伤、脑部疾病、一氧化碳中毒、低血糖等，可以逐一考虑一下有没有类似的情况发生过。可以入院癫痫综合评估。其中的一部分可能适合外科手术治疗，也有一部分不适合外科手术，仍然需要再次调整药物。
