一般情况下，小儿慢性腹泻的治疗方法有以下几种：
1、中医学：中医上常把小儿长期痢疾归因于脾虚、湿热、寒、伤食等，要结合辨证论治，有针对性的进行相应的处理。脾虚可以服用人参白术散，有痰的可以服用葛根芩连汤，有感冒的可以服用藿香正气散，有伤的可以服用保和丹，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
2、针灸按摩：可选择在腹部或肢体部位进行针灸或按摩，可在按摩后进行相应的按摩，从而减轻和改善慢性腹泻的情况，建议在正规的医生手法下进行针灸，才能达到较好的治疗效果。
小儿慢性腹泻需要及时就医检查，明确具体情况后及时对症治疗，还要注意日常护理。
首先要做一次粪便的检测。主要看是不是因为肠胃不好或者是因为胃病。出现消化不良时，可以服用一些抗炎症的药物，病情较重，需要进行静脉注射。多饮水，多吃些容易消化的食物。日常生活中要保持良好的个人清洁，要经常洗手，不要食用辛辣和油腻的食品。
小儿慢性腹泻是病程持续2个月以上的连续腹泻。
持续腹泻病程超过两个月考虑小儿慢性腹泻。临床上常见反复发作性腹泻及大便次数增多。慢性腹泻是由多种因素所致。感染、营养物质过敏、免疫缺陷、药物因素等，先天性的变形，急性腹泻没有得到彻底的处理或者处理不当，等，多见于儿童人工喂养及营养不良者。其病因主要是肠外营养不足或不能满足机体对各种营养素需要所致。慢性腹泻的治疗应重视肠道菌群失调的问题和饮食方面的问题。
小儿慢性腹泻在日常生活中经常能够碰到。从中医来说，小儿慢性腹泻包括中药内服、推拿和针灸的治疗方法。从内科的角度来说，小儿慢性腹泻很多是脾虚、湿热、外寒、伤食引起的。因此根据辨证论治的原理，外感寒证的小儿腹泻，主要表现是粪质清稀、胃口不好，甚至有恶寒、发热的症状，们一般采用外散风寒。
慢性腹泻常见症状：慢性腹泻是一种典型的慢性病症，病程长，大便的次数多，每天排便次数一般大于三次，便稀或便不成形，有时伴黏液、脓血。由于长期腹泻导致腹部不适感严重，尤其在餐后或者便前，不适感明显。结肠疾病引起的腹泻：结肠疾病导致的慢性腹泻有，会感到腹部不适，便后不适感缓解或减轻，排便次数多且急，粪便量少，常含有血及黏液。
母乳性腹泻是一种常见的疾病，如果出现了腹泻，首先要排除疾病，一般不适慢性腹泻。
母乳型腹泻的特征很明显，一天三到七次大便，大便是一种泡沫稀水样的，有一股特别的酸臭味，便便淡绿色，有泡沫，有时还会有一条半透明的粘稠液体。腹泻的时候没有发烧，没有明显的疼痛，也没有明显的哭闹，没有任何的感染，没有任何的症状，但是宝宝的精神状态很好，胃口也很好。
但如果腹泻的时间过长就比较严重，可能会导致生长停滞、营养不良等。