新生儿黄疸的原因是由于孩子体内的胆红素代谢紊乱，从而导致血液中胆红素浓度增高。婴儿黄疸是一种生理性黄疸。生理性黄疸一般在两个星期内就会消失。如果是早产婴儿，则会出现一星期的黄疸。另外，新生儿出现黄疸时会出现黄疸，这种情况一般会持续2-3个月。此外，新生儿的肝脏功能还没有完全发育，在新生儿的体内无法消化，导致血液中的血液被破坏，导致出现黄疸。
新生儿黄疸是体内的胆红素水平比较高引起，新生儿胆红素的来源比较多，出生之前新生儿在宫内处于一个相对缺氧的环境当中，出生之后缺氧解除，体内的红细胞会大量的破坏，产生了过多的胆红素。
孩子黄疸分为生理性黄疸和病理性黄疸，如果是生理性黄疸高，主要是由于孩子出生后，胆红素代谢慢引起的，多数14天以后能够自行缓解。病理性黄疸高，多数是由于胆红素代谢异常，引起的血清内胆红素浓度升高所致。
孩子黄疸高可能是因为胎儿在母体的时候需要过多的红细胞来摄取水中的氧气，胎儿娩出体外后，多余的红细胞就会自身破坏导致的生理性黄疸，也有可能是因为胆红素代谢异常，引起的血清内胆红素浓度升高所导致的。
黄疸是由于溶血引起的疾病，以血液系统为主，比如新生儿溶血，不同血型输血后引起的溶血等都可以导致黄疸，这类病人除了黄疸外，还有发热，寒战，呕吐，腰痛等症状。肝细胞性黄疸，主要是肝细胞广泛受损以后导致，比如病毒性肝炎，肝硬化等，除了黄疸外还有乏力，食欲减退，出血等症状。
新生儿发生黄疸的几率高，主要是因为：胆红素生成比较多，新生儿常有不同程度的酸中毒，会影响胆红素与白蛋白的联结，导致转运胆红素功能差，新生儿肝功能发育尚未完善，形成和排泄结合胆红素的能力均差，这些都会导致体内直接胆红素升高，形成新生儿黄疸。