主要症状有胃肠道症状：表现为大便次数增多到每天10多次，常考虑有腹泻，正常大便母乳喂养5-6次以内、奶粉喂养一日3次以内；大便性状的改变：出现水样便、黏液或者血便的情况。
新生儿肠炎会出现恶心呕吐，食欲减退，腹胀，腹泻，腹痛等一系列的症状，可以在医生指导下予抗生素以及抗病毒的药物治疗，同时需要给予营养支持，并且要维持水电解质平衡，避免出现水电解质平衡紊乱以及休克的症状。
以胃肠道症状为主，食欲不振，偶有溢乳或呕吐，大便次数增多（3～10次/日），无脱水及全身中毒症状，多于数日内痊愈，大便常规可见少量白细胞。急性起病，或由轻度腹泻转变而来。常有较为严重的胃肠道症状，尚可伴有较为明显的脱水、电解质紊乱及全身中毒症状，严重者可死亡。吐、泻亦可导致代谢性酸中毒，表现为精神萎靡，呼吸深长，严重者可昏迷。严重腹泻及进食不足亦可导致低钾血症及低钙血症。
首先会表现为大便的异常。孩子有肠炎以后，最先表现为大便次数的增多、大便的性状变稀，这属于肠炎最为常见的症状。其次孩子会出现消化道的不适症状，比如孩子会出现肚子胀、腹痛、阵发性的哭闹等，这都属于消化道的症状。
小宝宝出现身体不舒服，出现了一些胃肠感冒的一些症状。到医院检查发现是有肠炎。新生儿的常宝宝出现肠道炎症，可以引起发烧，腹泻的症状。所以检查发现有肠道炎症，通过用药治疗是完全可以恢复的，所以不要太担心，通过正规的用药是完全可以恢复正常的。
