果单纯性肾囊肿直径大于六厘米以上，或产生了压迫症状，可以通过肾囊肿去顶减压术来得到治愈，但是不能保证肾囊肿不再复发。然而如果是遗传性肾囊肿，通常表现为多囊肾合并多囊肝，目前来说没有办法治愈，仅在多囊肾囊肿较大时，可以通过去顶减压手术来得到缓解。
肾囊肿的治疗需因人因病情而异，不可一概而论，因为肾囊肿发展慢，在无症状时不损害肾脏，对健康无危害，且患者发现时一般年龄较大，因此对于无症状的患者，即使囊肿较大也可不行治疗，如患者腰部疼痛、排尿异常系由于肾囊肿引起，且肾囊肿直径在5cm以上，可采取手术治疗，但容易复发。
肾囊肿可单发或者多发，常见于男性，可压迫血管或者引发尿路梗阻出现病症，可有腰腹背部间歇性钝痛，继发感染可出现尿频尿急等症，B超，ct检查可诊断，手术治疗是有效办法。就诊肾脏外科检查治疗，适当补充高纤维、高维素食物，多吃新鲜蔬果，忌饮酒，少吃辛辣、油炸食品。
肾囊肿直径大于4cm之后就要手术治疗，或者是肾盂旁的肾囊肿压迫肾盂造成了肾积水，所以要手术治疗。因为囊肿直径大于4cm或者造成积水，会对肾脏造成一定损害，所以要手术治疗。
较小的一个是它可以用一些药物和食物来治疗。囊肿的治疗效果不是特别明显。治疗肾囊肿时，必须用手术治疗。然而，当肾功能在相对较小的临床市场中不受影响时，可以首先通过保守或观察来治疗。当蛋白尿或肾功能损害相对较大时，需要通过肾切除术切除囊肿。
