新生儿应该是打疫苗的，并不要因为有假疫苗的事件的发生而停止打疫苗，因为很多疫苗都是必须打的，在新生儿的生长发育过程中是非常重要的，要是没有注射，容易导致一些疾病和传染病的发生，影响宝宝的生长发育，不要过分担心假疫苗的事件，当今社会局势相对较好，国家监管力度也较高。注意观察新生儿的身体状况，如果出现不适应该及时去医院进行检查治疗。
宝宝自费疫苗是属于自愿的二类疫苗，家长可以根据宝宝的情况选择是否接种。
不过相当一部分自费疫苗都是很有必要的，比如流感疫苗、水痘疫苗、肺炎疫苗等，没有这些疫苗的保护，免疫力低下的宝宝就容易患上这些疾病，比如肺炎疫苗，较为健康的宝宝可以不用接种，但是体弱多病的宝宝就比较需要了，同样，流感疫苗也是抵抗疾病能力差的宝宝所需要的，因为流感会产生并发症，对宝宝的健康有很大威胁。
早产儿或者营养不良的新生儿是不适合注射疫苗的，因此父母应该及时让医生知道宝宝的各项身体状况，遇到这些情况时应该咨询医生后再商量对策。
新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗是按出生后24小时内。新生儿体重低于2250克，满月后就持预防接种卡去接种。早点接种疫苗是为了新生儿不会感染结核和乙肝，不会有什么事情。在出生后一个月内就为婴儿接种疫苗，不要超过一个月，之后的要打的疫苗就是国家免疫程序里的乙肝、百白破、麻风、麻腮风、流脑之类的。
如果宝宝是新生儿，那么它需要接种乙肝疫苗以及卡介苗，要避免挤压，也要观察化脓的情况，乙肝疫苗这一次要注意皮肤清洁即可，然后母乳喂养宝宝即可观察宝宝的体温变化，注意皮肤清洁。
新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。