小儿脑炎可能会有后遗症。
儿童患上了脑炎，主要是因为病毒感染，或者是细菌感染。这种病症通常都很重，不过也有一些孩子的症状很轻微，只要治疗一下就能痊愈。儿童脑炎也有一定的副作用，一般都是病情较重的表现，比如动作能力，语言能力，甚至还有癫痫发作等。因此一旦确诊为儿童脑炎，一定要根据原因进行治疗，避免留下任何的隐患。
通常情况下，小儿脑炎后遗症有肢体瘫痪、癫痫、智力低下等。具体情况分析如下：
儿童脑炎有两种情况，一种是化脓性脑炎，另一种是病毒性脑炎。化脓性脑炎的并发症有硬膜下积液，症状为化脓性脑膜炎，在治疗期间体温不升高，病程中前囟门进行性充盈；脑室管膜炎，主要表现为高烧不退，频繁抽搐，甚至是呼吸衰竭；脑积水、前囟门增大、头围逐渐增大、头皮静脉扩张等。病毒性脑炎一般在1-2个星期内痊愈，严重时会出现肢体瘫痪、癫痫、智力低下、失语、失明等后遗症。
另外，单纯疱疹病毒脑炎、乙型脑炎、肠病毒71脑炎的死亡率也较高。
小儿脑炎如果能得到及时治疗，是不会有后遗症的，但如果没有能够及时治疗，病毒性脑炎可能已经对婴儿的大脑造成了损伤，即使治愈了也有可能出现后遗症，甚至有可能出现小儿偏瘫的状况。
一般轻症的小儿脑炎经过及时的治疗，是可以完全被治愈的，不会有后遗症，只有特别严重的脑炎，或长时间没有得到合理治疗的情况下，可能会出现视力障碍、听力障碍等后遗症。
小儿脑炎后遗症主要表现为神经精神方面的异常，神经异常的表现多有：发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等。重者则大脑丘脑下部底节脑干小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。
是否出现后遗症与感染程度及治疗情况有关，脑组织损伤轻，后遗症不明显，损伤重则出现多种后遗症情况。轻症者有可能痊愈不遗留后遗症，危重者可导致死亡及后遗症。小儿病毒性脑炎，只要及时的得到治疗一般不会有什么后遗症的。