如果头顶疼的同时伴有发烧、喷射性呕吐，甚至是抽搐，这样可能是脑炎，需要做脑脊液检查确诊。如果头顶疼的同时伴有头晕、心慌、气短、乏力、胸闷等，可能是心脏或心肌损伤引起的大脑供血不足引起的。如果怀疑是脑炎，也需要做脑炎的相关检查的。
术后一般疼痛3－4天，在一周左右基本疼痛消失，这与个人体质有一定的关系，另外每个人对疼痛的耐受力也不同。术后时间短如昏迷者需保持呼吸道通畅，清醒后要保证充足的营养摄入。
脑炎的头痛并没有一个固定的位置，脑炎全身毒血症状有发热、头痛、身痛、恶心、呕吐、乏力。少数有出血疹及心肌炎表现。神经系统症状表现为意识障碍，脑膜刺激征。可出现颈肌及肩胛肌弛缓性瘫痪，以致头下垂及手臂不能上举，摇摇无依。脑神经及下肢受累少见。瘫痪2～3周可恢复，约半数肌肉萎缩。轻症可无明显神经症状。
脑炎头疼会持续一周左右或者两三天。
脑炎的病人如果有颅内压升高，会有头疼的感觉，这种头疼会持续多长时间取决于病人的病情，如果采取积极的药物治疗，可以缓解颅内的炎症，但是这种头痛并不会持续太久，有的病人会持续一个星期，可能只有两三天。建议患者可以及其去医院检查，因为不同的患者这种头疼持续的时间会有一定的差异。
脑炎患者腿疼考虑与长期卧床相关。
在临床上，脑炎通常不会直接引起腿部的疼痛。脑炎通常是由中枢感染引起的，一般会表现为发烧、头疼、头晕、恶心、呕吐等症状。发烧时可能会引起全身的疼痛，但这并不是单纯的腿痛。不过脑炎患者可能会长期卧床，不能定期调整姿势，进而可能会造成腿部疼痛。此时要做好相关的检查，才能有针对性的治疗。
脑炎患者若有头痛，一般常有全头部和额部疼痛较常见，但究竟是哪一部分，还要根据病人具体病情而定。
对于患有急性脑炎或者亚急性脑炎的患者来说，主要就是由于受到病毒感染而引起的疾病。通常脑炎的病因有多种病原体，如真菌，细菌等、病毒和其他感染引起中枢神经系统的炎性反应，则有些病人常有颅内压升高现象，以头痛、恶心、呕吐为特征的病例。另外一部分患者则是由于其他因素引起脑部受到损伤，例如肿瘤或者外伤等，所以这类病人常常出现额面部和枕部处的胀痛不适，并且持续时间较长。这类病人通常有此额部和全头部胀闷不适较多，然后病人就会由于有了这样的头疼，常使病人产生焦虑和抑郁情绪，影响病人睡眠，头疼的病人这类通常持续时间较长，而有些病人一旦疾病发展，有此持续性症状加剧时，具体哪一个地方疼痛，通常要观察病人病变在什么地方，还要根据病人具体情况而定。