一般来说，怀孕期间子宫有囊肿，需要判断是宫颈囊肿还是卵巢囊肿，如果是宫颈囊肿，这种情况不要紧，是慢性宫颈炎引起的宫颈内口腺体分泌物潴留引起的，不需要处理，宝宝出生后定期检查就可以了。如果是卵巢囊肿，根据囊肿的大小、有无临床症状进行判断。建议患者根据实际情况前往医院就诊检查，然后在医生的指导下进行治疗。
此外，孕妇应该保持良好的心态，同时注意休息，保证饮食营养的均衡摄入。
子宫囊肿的症状发生之后，病人就是会有月经不调的情况出现的，有的时候月经的量比较大，有的时候月经就会有不来的情况出现。这样的情况下，病人还是应该要积极的治疗子宫囊肿的症状。这样才有可能让月经重新出现。治疗子宫囊肿主要是靠药物的方法来进行。如果是比较严重的子宫囊肿症状还可以采用微波和激光的方法进行治疗。
子宫内膜异位囊肿破裂怎么办：可以行切口修补术，子宫内膜异位囊肿治疗的方式可以通过药物治疗，也可以选择手术治疗。这需要根据年龄、病变的部位和范围，以及临床症状和生育要求等情况全面的考虑。病变很轻，没有什么症状或是症状很小，这种可以过一段时间随访一次。如果有症状，不是很严重，首先做药物治疗，效果不好或是囊肿过大，都需要考虑手术治疗。
女性如果是在排卵以后，或者月经来之前检查彩超发现有右侧卵巢囊肿，而且又没有任何腹痛表现，就要考虑是不是生理性的黄体囊肿，通常这时候就可以考虑在月经干净以后再次复查彩超看一看囊肿变化情况，如果右侧卵巢囊肿考虑是炎症刺激导致的炎性囊肿，通常就需要考虑使用消炎药来进行消炎止痛治疗，如果是普通的卵巢囊肿而且小于五公分以下，可以不用进行特殊的处理治疗，如果大于五公分以上就需要考虑手术切除囊肿。
子宫内膜异位囊肿可以做宫腔镜，腹腔镜检查目前用于治疗子宫内膜异位症。腹腔镜对于女性是一种无痛无创的治疗方法。只需要一个3毫米的窗口，安全无痛，使异位子宫内膜安全。
卵巢巧克力囊肿也就是子宫内膜异位导致的，这种疾病很难治好的，即使手术也难以彻底清除，现在如果没有比较大的包块，可以继续用药物抑制月经来潮，至少六个月，可以减少复发，另外注意饮食清淡。