正常卵巢囊肿不治疗，自己好的可能性很小，特别是年轻女性激素活动频繁，更降低囊肿的自愈几率。如果不治疗可能会变大，卵巢囊肿万一变大，就可能使下腹或背部隐隐作痛或感到肿胀。
巧克力囊肿，症状不太明显，不影响正常生活，可以不用治疗的，注意观察。巧克力囊肿如果症状比较明显，影响了正常生活，到正规三甲医院采取手术治疗的。巧克力囊肿容易复发，每年要注意复查。
不同的病情有不同的情况。如果来月经的时候，痛经并不严重，只是偶尔的小肚子有点疼痛，一般不需要做手术，可以观察看，定期到医院去复查。下次复查的时候，到当地正规的公立医院去复查，如果明显的长大或者是痛经严重，就应该考虑做手术治疗了。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，如果不治疗囊肿会不断的增大，而且会影响到月经，还会导致不孕。另外大的囊肿容易发生扭转和破裂，这是非常危险的，还会有痛经的情况，一旦确诊就要积极治疗，选择治疗方案很重要，可以中医保守治疗，百通疗法治疗巧克力囊肿效果显著，可以使其逐渐的软化缩小甚至消失，而且可以提高卵巢功能促进不孕妊娠，不妨了解一下。
如果不及时治疗，可能会有以下危害。囊肿破裂危及生命，当巧克力囊肿生长到一定大小，有可能出现并发症，比如感染、囊肿蒂扭转、出血或破裂等，均能危及女性的生命。另外，囊肿在早孕时可能会引起流产，中期妊娠时可能发生囊肿蒂扭转，孕晚期可能会导致胎位异常。分娩时可能会阻塞产道，引起难产。因此巧克力囊肿及时去正规医院的妇科进行检查、治疗，以免延误病情，危害身体健康。
是良性的就不用治疗吗，巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种临床表现方式，如果严重了，影响了排卵，或是导致输卵管梗阻就会影响怀孕。可以先到医院妇科进行孕前检查，如果没有大的问题，可以先备孕。临床上，备孕一年不孕的，才需要全面检查。
