对于少量的有轻微阴道感染的宫颈囊肿的治疗，一般进行阴道清洗，或者是阴道局部的塞药，避免逆行感染，对于超过3公分的宫颈囊肿，一般采用手术治疗，除了常规治疗之外，还可以选择微波、激光、冷冻、电熨等。
宫颈囊肿一般发生在宫颈炎愈合的过程中。可通过妇科检查，宫颈细胞学检查，宫颈活检，B超检查，阴道镜检查等明确病情。宫颈细胞学检查可排除宫颈病变甚至宫颈癌前病变。
目前的症状和子宫囊肿没有关系的，要注意是不是妇科感染或者泌尿系感染所致，应该做尿常规和白带常规等检查的，如果是感染，用抗生素治疗的，囊肿属于良性占位，多没有症状，药物治疗效果不好，如果比较大，可以手术切除。
一般来说，宫颈囊肿属于慢性宫颈炎的一种，主要是宫颈表面腺体开口阻塞引起的。如果是单发的小囊肿，而且宫颈脱落细胞学检查无异常改变，通常随诊观察即可，一般不用治疗。如果是宫颈表面多发囊肿，而且有宫颈糜烂，可能会引发腰骶部坠痛、黄脓性白带等症状，一般要治疗。可以遵医嘱选择射频消融术或者是利普刀治疗。术后一个月内通常禁止性生活。
自身修复，需要一个过程，一个月左右。宫颈囊肿治疗的时间要多久是看病情的情况，不一样的体质，时间也不一样，宫颈囊肿是炎症刺激引起的，要积极局部阴道放药或者是手术治疗。