输卵管通水是会痛的。如果输卵管通而不畅，就算痛也需要做的，输卵管比较畅通，通水的时候，疼痛就会减少一点。如果输卵管堵得厉害的，那么通水的时候，疼痛自然就会严重一点。
输卵管通水会疼，一般输卵管通畅的情况下通液被检查者下腹部会有稍微凉凉的感觉，有下腹正中向两侧蔓延，不会有疼痛感；如果输卵管通而不畅通液时下腹部会有憋胀感，也会有微凉的感觉；如果输卵管堵塞通液时下腹部会有胀痛感。
如果输卵管堵塞，疼痛感会比较强烈。输卵管通水是一种将生理盐水注入输卵管，以测试输卵管是否通畅的检查，输卵管如果没有问题一般不感觉疼，如果疼可能是输卵管不通或通而不畅。
做输卵管通水一般来说正常的情况下是不会很痛的，只是少许的腹胀，有的人说就象是便秘的感觉，但是如果你的盆腔环境很差的情况下是有可能会疼痛的，因为输卵管粘连或者是盆腔的炎症，你水通过的时候有压力就会有疼痛的感觉。
输卵管造影术和输卵管通液基本上都是一样的，只是造影术是将造影剂打入子宫内，然后再拍片检查具看一下是否通，如果不通，能够看到堵塞的部位。做检查不会特别疼痛，有轻微的不适。如果造影检查有输卵管堵塞，那么可以采取手术治疗，比如输卵管导丝术。
在输卵管不通畅时行输卵管通水是会造成疼痛不适的，疼的程度与通的程度相反。考虑是输卵管有病变在检查过程中造成疼痛的，而且输卵管通水检查还有许多缺点，所以现在临床上经常使用输卵管造影检查输卵管堵塞、输卵管不通等输卵管疾病。