治疗附睾炎传统治疗主要以使用抗生素、止痛类药以及手术引流为主，这些方法通常只能缓解暂时的疼痛难受治标不治本，效果不能持久，而且长久服用会导致并产生耐药性副作用也大，故病人千万不可自行买药治疗一定要去正规的专科医院就诊以防引发并发症的发生。
慢性附睾炎治疗：慢性附睾炎常和慢性前列腺炎同时存在，所以一般治疗措施与慢性前列腺炎相同。治疗前列腺炎的同时可使慢性附睾炎的症状缓解，附睾炎愈合后遗留附睾硬结有时可造成病人的思想负担，手术切除后不一定都能缓解症状，因此一般不做除睾切除术。因双侧附睾炎后精子输出受阻的男性不育症，行输精管附睾梗阻部位近端吻合，虽能部分解决精子引流问题但术后受孕率不高。
附睾炎引起的不孕应首先治疗。附睾炎长期不治疗，可能影响精液质量。治疗附睾炎时，应先静脉注射消炎药，待症状好转后再口服药物治疗。像常用的消炎药这类的。另外，阴囊要尽量抬高，适当热敷，可改善附睾炎症状。
患有附睾炎之后简单的方法是采用局部理疗、外用药物治疗，对于反复发作的病人，可行手术进一步治疗。病人应卧床休息、避免步行太久、用阴囊托起阴囊减轻疼痛，根据病程不同，还可以采取冷敷、热敷、口服抗生素等治疗。
附睾炎梗阻这个需要通过手术治疗，如果是附睾炎导致输精管或者是射精管梗阻，就会影响到怀孕，需要积极配合治疗，规律饮食平时不要吃辛辣刺激，容易上火的食物，治疗期间需要禁止性生活。
附睾炎治疗可以肌肉注射或者静脉滴注，如果无缓解需要切开引流，同时配合物理治疗如热敷、红外线照射等。需要一个合理的治疗方案，不能间断服用药物，病情这样反复的发作容易导致睾丸炎、睾丸萎缩，甚至肿瘤可能。