肾脓肿是否严重，需要根据泌尿系彩超或者泌尿系ct和的全身症状来进行综合判断。如果有严重发烧、寒战，说明脓肿播散甚至引起菌血症或者毒血症以及通过ct判断脓肿的位置大小。
采用微化中药渗透的中医疗法，该疗法的中药活性物质促使囊壁上的血液循环与通透性发生质的改变，从而使得囊内液不断回收，不断减少，直至不再分泌。可以进行b超或者ct引导下穿刺引流，如果引流不畅或者脓液较稠以及有多个分隔，必要时可以进行腹腔镜下肾脓肿切开引流，达到彻底清创的目的。
治疗要花费1万元-3万元左右。具体费用因人因病情因治疗方式的不同而异，也因地区和医院而异，因为不同的医院有不同的收费标准，各地区经济发展水平不同，治疗费用就会不一样。
切除治疗术，早期肾穿刺造瘘鵻，充分引流，观察肾功能恢复情况若肾功能恢复鵻，则矫治梗若，功能鵻不能恢复，且对侧肾功能良好者，应行患侧肾切除术；保守治疗，选择敏感有效的抗生素，有助于将脓肿控制，消灭在早期阶段。
药物治疗结合早期的引流。传统的治疗提倡切开脓肿引流，在超声或CT引导下经皮穿刺安置适当大小的引流管也可以。如经皮引流无效时，必须及时切开引流或作肾切除术。对于肾周脓肿来说，仅用抗生素治疗是不够的。