孕期流褐色分泌物的原因如下：
当怀孕后孕囊进入宫腔后，孕胚着床的时候冲破子宫内膜导致的少量出血。这种情况是无需治疗的，一般在一段时间内就会自行痊愈。先兆流产症状。先兆流产是妊娠28周前出现的少量阴道流血，常为暗红色或血性白带，无妊娠囊排出，随后出现阵发性下腹痛或腰背痛。胚胎在与子宫壁着床部位有毛细血管断裂，就叫先兆流产。
孕期褐色分泌物可能是先兆流产或宫外孕，需及时到医院进行检查。
1.宫外孕：患者可能是宫外孕，当受精卵逐渐发育，导致周围组织受到压迫，从而受损出血，引起孕早期有褐色分泌物的问题。
2.先兆流产：患者可能是因为因为剧烈运动，或者是生活习惯导致先兆流产，从而引发子宫出血，引起孕早期有褐色分泌物。
孕早期有褐色分泌物说明存在出血问题，孕妇应该及时到医院接受检查，才能够避免发生意外。
如果在早孕的时候阴道有棕色分泌物，一般是由于胎儿发育不稳定引起的先兆流产，一般没有怀孕物质排出，但也会出现阵发性下腹痛或者腰背痛，这与胎儿自身染色体异常、母体身体状况、母体内分泌紊乱、生活习惯等因素、过度接触放射性线体等因素有关系，如果宫颈口没有张开，胎膜没有破，可以进行休养，如果出血量增多，需要及时就医，做好保胎。
孕期褐色分泌物可能是先兆流产、妇科疾病等因素导致的。
孕期出现褐色分泌物可能是先兆流产导致的素，平时要多注意多休息，避免剧烈的活动，尽量避免下床，2天后就会恢复正常。如果是因为妇科疾病引起的阴道流血，也会有褐色分泌物，需要到正规的医院检查，如果发现有妇科疾病，可以用红核洗液来冲洗外阴，红核洗液是一种中药制剂，而且是外用的，一般不会对胎儿造成影响。
孕39周有褐色分泌物的原因如下。
孕妇在怀孕39周时如果发现阴道有褐色分泌物，考虑是因为见红导致的，因为在孕晚期时，胎儿头部下降或是在宫缩的刺激下，可能会导致局部毛细血管破裂，如果阴道的血液和分泌物融合在一块，就会出现阴道有褐色分泌物的情况。如果孕妇在孕晚期有见红的情况，并且有规律性宫缩，可能是已经接近临产期，需要及时前往医院进行检查，及时办理住院手续，以便应对紧急情况。
孕早期正常阴道分泌物应呈无色无味粘液样。也有特殊情况。
妊娠早期有少量褐色分泌物，但是不伴随腹痛且持续时间短暂属正常现象，多考虑为胚胎植入后，穿入子宫内膜后造成少量流血，不能被吸收，所以形成褐色分泌物少量缓慢排出。
如果出现少量的分泌物且伴有腰酸、腹痛等症状时，应考虑有无先兆流产发生，需及时到医院论断和处理。