当女性在怀孕后有褐色分泌物出现时，这种现象的原因，主要有以下的几种情况。
宫外孕，一般是在停经40天左右，出现阴道流血的现象，一般伴有下腹部隐痛、胀痛、坠痛等症状，实时尿妊娠检查阳性。超声检查子宫内无妊娠胚囊，输卵管部位常有异常肿物。阴道滴虫感染会导致白带增多、恶臭、阴部瘙痒等症状，一般认为这是一种性病，容易在伴侣之间相互感染，治疗的同时还要对性伴侣进行治疗，避免交叉感染，彻底治愈。
在怀孕早期出现红褐色分泌物，是先兆流产，在怀孕早期会出现下腹的隐痛，伴有阴道少量出血，是先兆流产，经过1-2周的保胎治疗以后症状会逐渐的缓解，如果持续有阴道的褐色的分泌物，要做超声进行宫内妊娠的确认排除宫外孕。
怀孕早期出现褐色分泌物，可能是由以下几个原因导致：
1.受精卵刚着床引起的着床出血表现，一般出血量比较少，而且在1-2天左右可以自然干净。
2.考虑是孕激素偏低导致的先兆流产现象，常会伴有小腹隐痛，而且查血HCG和孕酮会发现孕酮偏低，这时就需要进行保胎治疗。
3.考虑是受精卵没有在宫腔内着床，而在宫外着床导致的宫外孕征兆。这时的褐色分泌物会持续出现，而且伴有下腹部的持续疼痛，在宫外包块破裂的时候，就会引起剧烈的腹痛甚至是失血性休克。建议及时到医院进行手术治疗。
通常妇女妊娠早期出现褐色分泌物，若考虑为受精卵着床所致，通常维持约2～3日，极少超过7日，超过7日则需要到医院进行检查和治疗。
若妊娠早期褐色分泌物时间长达7天或更长，此时并没有考虑为受精卵着床出血所致，而是因自身黄体功能不健全，致使孕酮降低所致先兆流产的表现。或因受精卵不着床于宫腔之内，着床于宫腔之外导致阴道出血的不正常表现。
怀孕初期有褐色分泌物可能是正常生理现象，也可能是疾病导致的异常情况，具体分析如下：
1.正常现象；受精卵形成后会在子宫腔内进行着床，受精卵在着床时会造成子宫内膜小血管的破裂，导致阴道褐色分泌物，一般1-2天可逐渐消失。
2.异常情况:若孕妇出现阵发性下腹疼痛，并伴随阴道出血，可能是先兆流产,应及时到医院就诊，遵医嘱使用药物进行保胎治疗；此外，阴道炎、宫颈炎等妇科疾病也可能导致有褐色分泌物，阴道炎一般可用碳酸氢钠清洗外阴，或用克霉唑栓剂局部用药，塞药时要动作轻柔，避免操作不当诱发宫缩，导致流产。
孕早期有褐色分泌物可能是因为胚胎着床时造成子宫内膜剥脱一部分。正常胚胎在发育时分泌绒毛促性腺激素，它虽能促进胚胎发育。
但同时又能促进子宫内膜增殖，内膜较厚时可局部脱落。若褐色分泌物量不多且无腹痛症状时，则注意休息，避免过于劳累。但若褐色分泌物量过大并伴腹痛时，应及时到医院就诊，在专业医生的指导下进行治疗。以免发生先兆流产。