孕39周半夜小腹持续疼原因如下：
妊娠39周的时候，如果有下腹部持续的疼痛感，可以考虑是不是假宫缩。假宫缩的特征是宫缩的持续时间不长，间断的时间很久，没有明显的规律性，宫缩的强度也不会增大，通常发生在晚上，早上会消失，服用一些镇静剂可以起到一定的作用。假如有周期性的、逐步增加的下腹痛，时长大约30秒钟，间隔5-6分钟，则应认为这是分娩的信号。
小腹右边疼，要考虑是不是得了阑尾炎。如果是右上腹有触痛，或者是出现了进展性的右上腹痛，都是急性阑尾炎的表现。
此外，小腹右边疼不一定是得了阑尾炎，也有可能是胃肠炎、肾结石等。其次是附件炎、卵巢囊肿、蒂部扭转等疾病。
如果月经延期，而且感觉到了小腹右侧有明显的疼痛感，也有可能是异位妊娠导致的。
半夜腰疼的原因如下：
1、考虑床过于柔软或床不平整，被硌着了，睡眠方式不好等原因造成的；2、腰部有瘀血、腰痛的表现，就好像是被针刺了一下，疼的地方是固定的，回来越痛，一天下来就会很不舒服，甚至是翻身都会很痛苦，这是可能与闪着，跌倒，坐起来的时候用力过大，受伤等原因有关。治疗方法是以活血化瘀，通络止痛为主，可以服用身痛逐瘀汤等药物进行治疗。
半夜胸口疼考虑是十二指肠溃疡，十二指肠溃疡的特点是饥饿性疼痛，因此要行胃镜检查，看看有没有十二指肠溃疡，如果有要给予治疗溃疡的药物治疗。另外要注意避免引起十二指肠溃疡的易发因素如紧张，要保持心情舒畅，要注意戒烟、戒酒。
一般情况下，小腹酸疼可能是妇科炎症、肌肉拉伤、肠道功能紊乱等原因导致的。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
如果女性小腹疼痛，可能是妇科炎症，如果有盆腔积液，也可能是附件炎，导致小腹疼痛。这时候要做彩超，看看有没有炎症，需要服用一些药物。在做激烈的运动时，会出现肌肉的拉伤，导致腹部的肌肉会出现僵硬。这个时候要做好自己的判断，如果做了激烈的运动，会不会有疼痛。如果出现肠道功能紊乱，出现便秘、腹泻等症状，可能会导致消化道功能的异常，从而导致疼痛。
一般情况下，小腹胀疼可能是以下原因导致的。分析如下：
小腹胀痛主要是由泌尿系统感染、输尿管结石、慢性肠胃炎引起的。饮食方面要注意规律，避免久坐，多做锻炼，避免出现肠胃不舒服，如果是由慢性肠胃炎所致的腹胀，则需要服用人参健脾丸等调理脾胃的药物，如果是由于泌尿系统炎症所致的小腹胀疼，可以服用诺氟沙星等消炎药。