清宫是个有创的操作，是用不锈钢器械进行刮宫，在这个过程中有可能会出现出血，感染，子宫穿孔甚至有些人因为牵拉宫颈，造成迷走神经兴奋，引起类人工流产反应综合征，出现心率减慢，呼吸心跳骤停。
清宫手术一般是流产之后有胎盘组织残留，或者是子宫内膜偏厚导致月经不停，月经淋漓等才需要清宫，清宫有可能会损伤子宫壁，无痛人流后宫腔积血多发生在人流术后几小时内，人流病人腹痛难忍，妇科检查发现子宫增大明显，质软，有触痛无痛人流后子宫穿孔人流手术中发生的一种很严重的并发症。
一般来说，药流残留30mm不清宫，会引起炎症、宫腔粘连等。
如果身体吸收了这些残留的物质，会产生一些对患者的凝血功能不正常的物质。另外，如果体内的组织结构经过长时间的机化，要刮宫，不一定能刮掉，甚至需要进行电切，这样会增加手术的难度；如果它们还活着，在身体里不断的增殖，就会引发一种叫做营养细胞的恶性疾病。
清宫丸在使用过程中也可能引起腹痛、出血或分泌物异常，因此有必要在医生的指导下积极安排体检。如果感染得到确认，考虑用药会更安全。同时，建议调理身体。在用药过程中，仍有必要避免性感染的加重，并注意外阴卫生。
二次清宫就相当于对子宫内膜的二次损伤，危害就是可能会损伤子宫内膜基底层，导致清宫后内膜不能及时修复，而引起内膜薄，甚至是导致子宫内膜的粘连，从而影响再次怀孕。由于是二次清宫，所以在清宫的时候，还可能引起子宫穿孔的危害，甚至是导致宫腔内的感染，引起子宫内膜炎症。
无痛清宫是指在麻醉状态下行清宫手术，危害是药物的副作用，如过敏，用量没有把握好，引起昏迷，甚至发生意外。药物引起的恶心呕吐，呕吐物堵塞气管而引起窒息。另外就是因为无痛，在进行手术操作时，子宫穿孔了，也不能及时发现。还有子宫收缩不良，流血多，感染，损伤临近器官的危害。
