原因是血栓性疾病，如脑血栓、冠心病、下肢静脉血栓等。同时在形成血栓前的状态，也会出现活化部分凝血酶原时间偏低。活化部分凝血酶原时间，是反映内源性凝血途径的指标。
可能是出现心肌梗死或者脑血栓形成的时候凝血酶原时间会偏低，或者有急性血栓性静脉炎，多发性骨髓瘤，洋地黄中毒以及乙醚麻醉发病后，也会出现凝血酶原时间偏低的现象。
多见于严重的肝病，维生素K缺乏，纤溶亢进血管内，弥散性血管内凝血，使用抗凝药物如口服抗凝剂和异常抗凝物质的存在等。凝血酶原时间是外源性凝血系统的检测指标。
凝血酶原时间的测定可以反映肝脏的储备功能，合成功能以及肝脏疾病的严重程度，凝血酶原时间偏高，说明存在肝脏的损伤，凝血时间相应延长，如果受伤的话，凝血时间会延长，对止血不利。需要进一步检查，并及时治疗。
凝血酶原时间偏低常见于血液高凝状态的时候，比如在DIC早期、心肌梗死或者脑血栓形成的时候凝血酶原时间会偏低。另外，在急性血栓性静脉炎、多发性骨髓瘤、洋地黄中毒以及乙醚麻醉后，也会出现凝血酶原时间偏低的现象。
孕期间这个药物原时间偏低，指的是凝血时间提前，血液处于一种高凝状态，容易引起血栓。虽然能够防止产后大出血，但是容易发生弥散性血管内凝血。而导致相关药物原时间降低的原因可能和高血脂有关，比如饮食中摄入的胆固醇脂肪类物质太多。