宫颈癌疫苗严重的副作用就是过敏性休克，因为宫颈癌疫苗是蛋白质，如果病人是特异体质，对某种蛋白质过敏，就有可能会出现过敏性的休克，过敏性的休克会影响到病人生命。
宫颈癌疫苗副作用很少，注射宫颈癌的疫苗与普通的注射其它的疫苗一样，并没有很明显的不良反应，只有极少部分的人因体质的不同，出现部分的不适。主要有在接种部位，出现红，肿和硬结，疼痛是非常常见的副作用之一。
宫颈癌疫苗的副作用接种后会表现为发热、局部红肿、瘙痒等常见的疫苗注射不良反应。在选择注射宫颈癌疫苗时要注意不要在发热、感冒、感染性疾病急性期等进行注射，以免发生疫苗不良反应时难以鉴别。
打宫颈癌疫苗有导致注射部位的红肿、疼痛、发烧、恶心以及皮疹等副作用，但是持续时间都不会太长，多可自行缓解，不需要特别处理。可以通过注射宫颈癌疫苗起到预防宫颈癌发生的作用。
4价宫颈癌疫苗，是指可预防HPV6、11、16、18这四种人乳头瘤病毒所导致的疾病。通过预防HPV病毒感染，可有效预防宫颈癌，防止人体感染疫苗所涵盖如宫颈癌、口腔癌、阴茎癌、喉癌、肺癌和肛门癌等。
宫颈癌的疫苗在接种过程中，和其它的疫苗出现的副作用基本上是相似的。比如接种部位的疼痛、红肿、过敏，还有的人会因为过敏出现局部的瘙痒等，少部分人可以出现头晕、呕吐症状，但是一般在两天内就会消失。