怀孕六周出血的原因可能是先兆流产。
先兆流产在怀孕早期是较常见的现象，孕妇在怀孕早期出现下腹部隐痛，伴有阴道少量出血的症状，在超声检查时如果看到宫腔内有妊娠囊和卵黄囊，确认为宫内怀孕排除宫外孕以后，要考虑是先兆流产。如果是先兆流产孕妇应及时前往医院进行检查和治疗。同时孕期出血的孕妇要注意卧床休息，避免激烈运动，同时还要减少下蹲动作。
怀孕6周也就是停经40多天，这时如果出现见红，也就是阴道流血，有可能是先兆流产，也有可能是胚胎停止发育，还有可能是难免流产。所以出现见红，要及时到医院去做B超的检查，如果能够看到孕囊或者胎心、胎芽比较正常，首先要保胎治疗。
如果怀孕六周出现出血的情况，有可能是孕酮低引起的，可以去做一个抽血化验，看孕酮数值是否正常，在保胎治疗期间，是需要禁止同房，以免引起出血量增多的现象。平常是需要注意卫生，勤换内裤，清洗后在阳光下暴晒，不要给自己过大的压力。
由于怀孕前两个月的时候，孕囊较小，因此，很可能B超上是看不见的。也会有宫外孕的情况，但概率很小。通常情况下，妊娠4-5周时超声检查可见到孕囊的位置，结合血中HCG的含量，可判断是否为宫内孕或宫外孕。若经腹超声观察不到，可能需要改为经阴道超声。
正在准备怀孕的妇女，如无阴道出血、腹痛及其他症状还应于停经后约50天时去医院就诊，必须在医生的意见下进行B超检查，清楚是否为宫内妊娠或宫外孕。
怀孕六周肚子隐隐作痛多是因为以下原因导致的。
孕妇在怀孕六周的时候肚子出现隐隐作痛的情况，首先需要考虑是子宫逐渐增大导致的，其次可能是出现了先兆流产的情况。另外，孕妇还可能因为饮食不当或者腹部着凉引而导致肚子疼。所以孕妇出现肚子疼的情况需要及时到医院进行检查，明确肚子疼的原因，并积极进行针对性的治疗。