怀孕三个月肚子疼有很多原因，有一部分是正常的生理现象，一般生理性腹痛不是很严重，发作时间也很短暂，主要是因为怀孕后子宫变大，子宫韧带受到牵拉导致的，一般不会影响日常生活也不用治疗。
应该尽快到医院的妇产科检查一下，首先要明确是什么原因引起的，可以依照检查的情况及时的给予治疗，并尽快的改善症状，避免出现流产的问题。怀孕期间要注意合理的饮食，保持放松舒缓的心情，定期的做孕期各项检查。
怀孕初期肚子疼需要根据不要进行针对性治疗。
怀孕期间出现腹痛的原因有很多种，可能与妇科、消化系统等疾病有关，建议患者及时就医进行仔细的检查。怀孕期间出现腹部疼痛并出现阴道出血的情况，首先要到医院进行子宫附件的彩超和孕酮、绒毛膜促性腺激素等检查。如果腹痛不是在小腹，需要考虑是消化系统、泌尿系统等方面的问题。
通常情况下，在怀孕早期出现肚子疼腰疼考虑是先兆流产引起的。
在怀孕早期，在雌激素和孕激素的刺激下，孕妇会出现腰酸腹痛的症状。随着胚胎的发育，子宫逐渐增大，子宫肌肉纤维受到牵拉，也会导致下腹部不适。建议孕妇在怀孕早期，口服叶酸片来预防前往胎儿的神经管畸形。如果出现腹痛加重，并伴随阴道见血，要及时前往医院就诊。
刚怀孕不久造成腹部疼痛的原因如下：
怀孕不久的女性产生腹部疼痛的症状，首先需要检查阴道是否产生流血的症状，再去医院进行检查化验孕酮水平和绒毛膜促性激素水平，还有通过子宫附件的彩超来检查孕囊和胎心胎芽的发育情况，当一切都表现为正常是，可以适当运动休息，避免劳累受凉导致感冒等，注意少吃生冷辛辣刺激的食物。
怀孕老是肚子疼可以通过生活护理、药物治疗来改善。
妊娠初期和中期不能有腹部不适，到了怀孕后期会伴随着胎儿的降低而发生假性宫缩，主要是因为下腹部不规整。怀孕初期，如果有下腹部的不适，一定要及时到当地的医疗机构进行B超和胎心监测。排除早产、流产、胎盘早剥等常见的产科疾病。如果下腹部疼痛没有好转，需要进行静脉输液的方式。观察术后子宫收缩情况。如果没有出现宫缩症状，可以暂停使用。