胚胎质量差是因为胚胎的染色体不好，胚胎的染色体异常会影响到胚胎的正常发育，所以染色体异常是胚胎发育不良的重要的原因。所以如果多次出现胚胎发育不良，需要到医院进行男女双方的染色体检查。
孕期接触有毒有害物质，接触有辐射的东西，比如X射线，会影响到胚胎的发育。另外双方染色体异常、妇科疾病等，导致胚胎质量不好，影响发育，很容易流产。如果胚胎质量不好没有必要保胎，即便保胎成功，宝宝发育也会有一定的缺陷。
导致胚胎质量差的原因有很多，如考虑是男性精子或者女性生殖细胞的异常，和理化因素，孕妇和产妇应尽量不要使用化妆品，不要接触放射线，也不要随便吃药。应该多吃含维生素丰富的蔬菜和水果，适当运动，增强身体抵抗力，减少细菌或病毒的感染，这有利于提高胚胎质量。
导致精子质量差的原因：1毒品：有些毒品如大麻可使血液中雄激素水平降低。2体内缺锌：会使性欲及性功能减退。3.情绪影响：影响机体的神经系统和内分泌功能，使睾丸生精功能发生紊乱。4.房事过频：房事过频会使每次射精，精液中的精子量减少。5.温度：高温对睾丸会产生损害。6.烟、酒：烟草中产生的尼古丁和多环芳香烃类化合物会引起睾丸萎缩和精子形态改变。7.辐射：辐射对人体的健康已被确定有明确的影响。
不会，卵子着床以后开始生长，而滋养细胞开始分泌HCG。所以受精卵无论是游离2天着床，还是游离3天着床，都是在正常的情况下着床的，对胚胎的质量不会造成任何影响。而受精卵的着床，没有早晚之说，只要进入宫腔之后2到3天着床，都是正常的。
胚胎质量不够好，或者胚胎质量好但是子宫内膜不好，或者内分泌环境不好，都可能造成胚胎移植不着床。所以说不着床的原因是多方面的，目前并不能肯定是哪方面原因导致。建议试管移植成功后肌注黄体酮和血HCG帮助孕囊正常发育。