性功能障碍应加强对性知识的引导，消除对性问题的忧虑和恐惧，纠正错误的性观念和性交方法，使夫妻的性生活协调一致。心理治疗强调个体化治疗，常用的有心理分析、厌恶疗法、全身脱敏疗法、家庭疗法等。主要通过性集中训练，使之逐渐适应，熟悉性交过程，提高自己的性反应意识，充分享受性交的快感，减少对性交的焦虑和恐惧。在治疗过程中，另一方应避免性体验、性自尊和性幻想的不良刺激，避免有害的性吸引活动。耻骨尾骨肌训练对于骨盆底肌松弛或产后耻骨尾骨肌发育不全的妇女尤其有效。
如果有什么问题，可以通过药物来解决，比如缓解患者的性功能失调，以及对原因进行治疗。
还有，就是治疗这种性机能失调的原因，比如患者发现荷尔蒙有问题。要注意调整体内的荷尔蒙，如果出现了血糖和血脂方面的问题，一定要注意控制。总之，这种性机能失调的疗法，除了对这种疾病的疗法之外，还包含了导致性欲失调的原因，其中还包含了对原因的控制。
对男性性功能障碍来讲，心理障碍是最常见的，大约有90%以上的，并没有器质性病变，都是由于心理原因造成的，由于封建社会的思想，因此男子有自我封闭的意识，这一点与西方男子有很大的区别，因此自我调整心理是最重要的治疗。
根据每个病人的情况不同，会采取不同的治疗方法。从医疗角度的方法会有手术治疗，还有一些心理治疗，还有性教育，是出于现在对性问题的一个顾虑和担忧，所以要纠正错误的观念才能够使夫妻间的生活变得更加和谐。还会有物理治疗，如用电动的按摩器刺激男性的生殖器官。
可以通过心理治疗、药物治疗等方式治精神性功能障碍。
性功能障碍，临床较多，对精神性性功能障碍者来说，或采用主动心理咨询，心理疏导等方式治疗，也许能收到一些成效。同时，心理治疗时，也可酌情辅助性地应用某些药物进行治疗，如采用抗焦虑，抗抑郁用药处理，可能对于性功能障碍症状有一定改善，还能有所裨益。另外还有一种情况就是由于夫妻双方都存在不同程度的心理障碍，或者是一方出现了心理疾病，而导致性功能障碍，此时就需要通过咨询医生的方式，了解自己的问题和原因。当然，还有一些病人，可能是夫妻关系紧张导致关系恶劣，因而导致性功能障碍，因此应该主动交流才能使性功能障碍表现出来，获得逐步缓解。
男性出现性功能方面的障碍所引起的原因是比较多的，比如压力过大，以及频繁的手淫，都有可能会引起阳痿或者是早泄，过度的纵欲，手淫导致的肾虚，治疗方法是不同的。检查确诊病因在针对性治疗手术物理药物都有；要规范管理性生活心态一定要放平。