精子畸形率98%很少见的，精子畸形与受精能力有很大的关系，精子畸形率高，受精能力会相对减弱，从而造成不育。但与胎儿畸形其实关系不是很大，胎儿畸形更多的与遗传、母体环境、用药、外界不良环境等因素有关。
一般情况下，精子畸形率达98%是不正常的，因为畸形率过高会影响到女性受孕的能力，进而导致男性不孕。具体情况分析如下：
男性精子畸形的原因可能是工作环境受到辐射，比如从事辐射、电焊工、X光检查等，如果防护措施不到位，精子就会发生畸形甚至死亡。如果患者想要性伴侣怀孕，应该及时调换工作。当然，如果没有这方面的需求，也不会对身体健康造成很大的影响。
营养缺乏：与精子产生和成熟相关的微量元素锌、硒最为重要。日常饮食也会影响精子的质量。饮料、油炸食品、烧烤等食物中，所含有的有毒物质及反式脂肪酸等都会对精子质量产生影响。
性功能比较差，精子畸形率比较高，这些都可能会影响正常的生育，很多原因都会发生，喝酒吸烟比较多，手淫过度，性生活太频繁在高温高辐射环境下工作都会影响精子质量。进一步完善精浆弹性蛋白酶检查，抽血化验性激素和抗精子抗体，做阴囊彩超，这样才可以明确病因，再针对病因来治疗。
一般情况下，精子畸形率98%严重，受孕的几率比较小。具体情况分析如下：
正常情况下，男性进行精液例行检测时，a类b类的精子总数要超过50%。而精子畸形率98%，患者需要在医师的建议下进行治疗，同时还要注意检查引起精子异常的原因，如焊接工人、长期接触射线等辐射职业，需要考虑更换工作。此外，如果患者平时在工作中接触重金属，可以口服一些生精片等药物进行调节。