阴茎勃起时出现疼痛，多由于阴茎包皮系带过短和包皮过长时的包皮口过窄引起。包皮系带是指包皮与龟头相连的皮肤，位于龟头下方尿道口处。当阴茎勃起时，如果包皮系带过短就会牵拉龟头导致阴茎弯曲，牵拉过度出现疼痛。包皮过长的男性，如果包皮外口狭窄，当阴茎勃起后胀大的阴茎体或龟头就会因包皮口过窄受到压迫，出现疼痛，如果不能及时复位，严重的会出现包皮水肿甚至包皮缺血坏死，医学术语就是包皮嵌顿，需要紧急手术松解。
有包皮龟头炎的可能性的，病因多见于包皮过长、包茎、手淫、外伤感染等，导致角化上皮脱落和腺体分泌，为其他细菌形成良好的繁殖条件，引起炎症，其临床表现多见于局部瘙痒、红肿、糜烂、甚至成溃疡，出现分泌物、有异味等，严重情况下可以有发热、寒战全身症状，甚至阴茎肿大、疼痛等。
症状有：后尿道、会阴和肛门处坠胀不适感，下蹲、大便及长时间坐在椅凳上胀痛加重。放射性疼痛：慢性前列腺炎的疼痛并不止局限在尿道和会阴，还会向其附近放射，以下腰痛最为多见。另外，阴茎、精索、睾丸阴囊、小腹、腹股沟区、大腿、直肠等处均可受累。
胸椎疼痛的症状，常见的有胸椎骨折、胸椎小关节错位、胸椎间韧带损伤、胸椎结核或者胸椎肿瘤等等。胸椎骨折出现疼痛位置固定，相对比较局限，哪里出现骨折，疼痛就会在哪里，骨折处用拳头敲击时会出现剧烈的疼痛。
严重的是淋病。开始尿道口灼痒、红肿及外翻。排尿时灼痛，伴尿频，尿道口有少量黏液性分泌物。3～4天后，尿道黏膜上皮发生多数局灶性坏死，产生大量脓性分泌物，排尿时刺痛，龟头及包皮红肿显著。
