严重的精子畸形采取药物治疗。引起精子畸形怪状主要与先天性睾丸发育不全、精索静脉曲张、副睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频等有关。此外，酗酒和长期饮用酒精含量较高的烈性酒，可以损害睾丸生精细胞功能、干扰精子生长成熟，使精子畸形。
精子畸形率不能超过20%，当然，还需要看精子成活率、液化时间、精子活动率等指标。精子畸形率高大多数与睾丸的功能障碍有关系，如长期手淫、体质较差、营养不良、休息不好等都有可能造成障碍；另外，有的与炎症有关系，如睾丸炎等。可以先考虑中药治疗。到正规的三级医院进行诊治。
严重的症状就是会不育。还有一部分病人有性功能障碍。但是大多数的症状是，倦怠乏力，纳食不香，腹胀，腹闷，或者出现腰膝酸软，伴有精索静脉曲张，还可能有睾丸坠胀表现。
精子畸形可以使用裴尔科密度梯度离心法。对自己的精液中的精子进行分离，通过这种方法，能够分离出活动力在Ⅲ、Ⅳ级并且形态正常的精子。在成功分离后，在进行人工授精。除减少烟酒危害、控制房事次数、保持阴囊适温、注意劳逸结合、加强身体锻炼外，还应注意生活环境，合理调整饮食。
如果是男性因为生殖道出现了感染，而导致了精子出现异常，这个时候应该进行抗感染治疗。如果是因为男性的内分泌出现了异常，就应该是调整自身的内分泌的功能。如果是男性不想进行长时间的调整，可以用一些裴尔科密度梯度离心法，对精液中的精子进行分离，通过这种方法可以找到形态正常的精子，再进行人工授精，这也是一个办法。