生殖器疱疹的潜伏期为2～20天，平均6天，也有数月不等。很多初次感染生殖器疱疹因为无临床症状，而忽视了治疗。生殖器疱疹在潜伏期是能检查出来的。在潜伏期，可能症状不是很明显，但是可以通过临床化验检查出来的。
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒（HSV）引起的性传播疾病，是常见的性病之一。生殖器疱疹可反复发作，对病人的健康和心理影响较大；还可通过胎盘及产道感染新生儿，导致新生儿先天性感染。因此该病也是较为严重的公共卫生问题之一，应对其有效的防治引起重视。
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的，主要是Ⅱ型的单纯疱疹病毒感染引起的，这种病毒在感染以后一般几天时间就会在接触的部位引起水疱，长的也就是十几天时间，所以这个病的潜伏期一般是几天到十几天，极为少数的可以到三周左右。
4周左右是潜伏期，需要去医院正规治疗的，才可以保证治好对的，期间应该避免性生活的，注意休息，多喝水，少熬夜，勤用温水清洗，不要吃辛辣刺激，油炸油腻的食物，适当参加体育锻炼的。
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒导致的一种性传播疾病，它是发生在生殖器部位或者是肛周。首次发生生殖器疱疹，它的潜伏期是2-14天，一般是在肛周、生殖器部位出现成簇的小水泡，水泡破溃以后会有明显的疼痛感，而且会自行愈合，而且会伴有全身感染的症状，比如发烧、头疼，局部淋巴结肿大，全身乏力。
生殖器疱疹的平均的潜伏期，一般是在两周到两个月之间。如果有过高危性行为的话，可以注意观察生殖器的情况，如果没有水泡疼痛，溃疡的症状，两个月以后应该就没有太大问题的。