生殖器疱疹可以采用中西医结合的方式治疗。中药的话要去正规中医院去治疗。平常应该注意饮食，在用药期间，避免辛辣刺激的食物，多吃新鲜水果蔬菜，可以提高身体的免疫力，经常查一下尿常规和肾功能，减少对肾脏的损伤。
生殖器疱疹多数是由于不洁的性生活所引起的病毒感染，在中医，多数是由于肝经湿热下注引起的火毒，所以，生殖器疱疹用中医可以进行治疗，主要有内治法和外治法。内治法主要是服用中药，另外，还可以用外治法进行治疗，主要是用火针刺破疱疹。还可以用针灸针刺破疱疹以后，外敷清热解毒的药物进行治疗。
中药治疗效果差。出现生殖器疱疹，是由于疱疹病毒感染引起的，与不洁性生活有关系的，主要表现为生殖器出现水泡，伴有明显的疼痛感觉。要注意保持局部清洁卫生，避免瘙抓，避免不洁性生活，可以使用抗病毒药物治疗。
生殖器疱疹目前没有特效的药物。1：提高自身免疫力2：用中医中药结合经络治疗可以控制疱疹病毒的复发。建议戒烟酒，不吃油炸烧烤辛辣上火的东西不用过热的水洗澡，并且平日多喝温开水。
中医药治疗复发性生殖器疱疹病人往往具有劳累、心理焦虑等情况，因此在积极抗病毒治疗的同时，可给予一些健脾利湿、清热解毒和养肝滋肾、滋阴清热的中药。治疗生殖器疱疹需要从局部的黏膜来处理病毒，彻底清除病毒后，做中药制剂的巩固治疗，后期避免复发。
应注意合理的清热解毒，可以用外洗的方法，内服中药的方法就是通过常规的抗病毒的中药，可以是白芍，或者是选择清热解毒类的药物，还有就是补脾胃，益肺气的药物散外用。