传统的手术、药物、激光等物理疗法只能清除表面的疣体，并不能彻底将病人体内的病毒排除体外，反复地复发，从而导致病情加重。但是随着科学技术的不断进步与发展，目前出现了一种较科学的治疗方法能彻底清除体内病毒，快速治疗不反复。
尖锐湿疣产生的抗体一般无耐药性，无功能作用，检测是否感染相关抗体不准确，临床实验未证实，抗体检测非常困难。效果不高。很容易漏诊和误诊，所以只有通过病因检查才能明确诊断。抗体产生时间为两周。
尖锐湿疣属于病毒性皮肤病，确实容易复发，如果杀毒彻底，尖锐湿疣也不会复发的，可以使用植物杀毒水，通过皮肤疣体杀毒来使疣体脱落，病毒清除后基本不会复发，痊愈率比较强。
尖锐湿疣常用的治疗方法有激光、冷冻、电凝、药物等，但复发率都比较高。目前好的治疗方法是光动力疗法，原理是光敏剂与病变组织结合，在光的作用下产生单线态氧，导致病变组织崩解死亡。建议治疗期间的情况下，一定要注意多锻炼身体的，建议早发现早点去处理治疗的，可以通过性生活交叉感染给性伴侣的。
孕期有尖锐湿疣主要是进行冷冻治疗。
疣病毒感染是导致尖锐湿疣的主要原因，由于身体的抵抗力和免疫力低下，孕期可能加重病情。尖锐湿疣患者若采取阴道分娩，新生儿也可能出现感染的情况，尖锐湿疣还可能导致宫腔感染，因此孕期患尖锐湿疣，要根据医生指导慎重选择是否还能继续妊娠。若疣体较大建议做好终止妊娠的心理准备。
