肛门疣早期可以做冷冻治疗，冷冻疗法无毒性，不需要进行麻醉，若应用得当，不致引起疤痕形成，也可以激光治疗、手术治疗，术后注意抗炎，不宜吃辛辣和刺激性的食物，注意卫生。
早期肛门疣是可以治好的，但是有25%的会有不同程度的复发。肛门湿疣的治疗，首先，治疗方针是对于比较大的湿疣，选择手术切除，对于比较小一点的，可以用激光烧灼或者用试剂外涂使之脱落。
尖锐湿疣是病毒感染引起的一种感染性疾病，具有很强的传染性，可以去医院皮肤性病科行激光祛除术，肛周湿疣的治疗常用的有激光、冷冻、光动力等先将疣体清除干净，后期配合药物治疗。
肛门疣的中医治疗是通过中药在病灶上的皮肤、毛细血管吸收、渗透，达到疣体自然枯萎、脱落的效果。患者可以去皮肤科让医生先检查下，这个需要和痔疮鉴别诊断，然后再对症治疗用药。
肛门疣症状是在其发病部位起一针尖或粟粒大小淡红色或呈皮肤粘膜色的丘疹，随后损害逐渐向皮肤或粘膜外生长，并逐渐增大、增多，形成各种大小形状不同的赘生物或肿物。平时少吃辛辣刺激性食物，少吃油腻，多吃瓜果蔬菜。