可以外用药物去治疗，也可以物理治疗。首先选用外用药物，主要适合于扁平疣物理治疗，比如选用冷冻、电烧以及激光的治疗效果都是不错的。包括系统性的药物治疗，可以选用干扰素、左旋咪唑等，都可以有效的去治疗扁平疣，效果都是不错。
如果有多年的扁平疣，疾病是很难完全治疗好的，治疗好之后也有可能会复发，首先可以对症用抗病毒的药物，同时还可以配合用一些免疫调节类药物，平时生活中在饮食上也要多注意，不要食用过多的辛辣的刺激性食物。
大部分发现扁平疣可以去医疗中心开中药外洗，每天两次。皮肤消毒以后选用推疣的方法，将疣体推掉，一般采用具有腐蚀作用的中药进行腐蚀，如果扁平疣体积较大，也可以采用针灸的办法。
一般情况下，扁平疣是一种人乳头瘤病毒感染导致的皮肤病。具体内容如下：
不注意个人卫生、病毒感染等原因可能导致患者出现扁平疣，这是一种人乳头瘤病毒感染导致的皮肤病，患者可以及时前往正规医院，在医生指导下使用维A酸乳膏、重组人a-2b干扰素乳膏等药物进行治疗，如果情况严重，还可以前往正规医院，通过液氮冷冻、激光烧灼来治疗。
扁平疣治疗上可以用物理疗法或药物疗法、中医中药疗法等。物理治疗主要选用液氮冷冻和激光治疗、疣组织包埋疗法。中医中药疗法有耳后放血法、火针法、穴位注射法等。药物治疗可以服用增强免疫的药物，因为扁平疣多发生于免疫力低下人群，免疫力增强后，有自身清除病毒的可能，扁平疣是有自愈性的。
