扁平疣确实有一定的复发几率的，此病是由于病毒感染引起的，存在着一定的复发几率，有很多人治疗扁平疣后没过多长时间，疣体会自行复发，对于扁平疣的治疗要除疣体，还要结合抗病毒的药物进行治疗。
如果单纯手部有少量的扁平疣，可以通过激光、或冷冻等方式祛除，也可以用火针点刺治疗，本病好发于免疫功能低下人群，所以，需要配合口服提高免疫力的药物来进行调理。至于怎么治疗最有效，需要根据个人的情况来具体分析。
扁平疣的治疗主要采用外用药物治疗和物理治疗，内用药物治疗多用于皮疹数目较多或久治不愈者。内用药物治疗，目前尚无确切有效的抗人类乳头瘤病毒治疗药物，可试用免疫调节剂。同时还应该注意饮食健康，不要吃太多油腻的食物。
扁平疣个数少者可以外涂抗病毒软膏治疗，如果个数较多，受损皮肤面积较大，可以用皮下埋植自体免疫疗法治疗，可以根除。一般埋植后2个月会自行脱落，如果4个月不愈者，可以再埋植一次，还可以激光治疗。
扁平疣的治疗主要采用外用药物治疗和物理治疗，内用药物治疗多用于皮疹数目较多或久治不愈者，物理治疗包括冷冻、电灼、刮除和激光等，适用于皮损数目较少者。内用药物治疗，目前尚无确切有效的抗人类乳头瘤病毒治疗药物，可试用免疫调节剂；中药以清热解毒，散风平肝，散结为治则，有时可获得较好的疗效。
治疗扁平疣的物理治疗包括冷冻、电灼、刮除和激光等，适用于皮损数目较少者。内用药物治疗，目前尚无确切有效的抗人类乳头瘤病毒治疗药物，可试用免疫调节剂；中药以清热解毒，散风平肝，散结为治则，有时可获得较好的疗效。