新生儿呼吸困难的病因有：
1.生理性：当鼻腔狭窄、鼻道较薄弱、喉管较柔软时，宝宝的呼吸会出现堵塞。
2.喉软骨软化：婴儿因缺钙引起喉软骨软化，在吸入时喉软骨发生塌陷，引起局部阻塞。
3.新生儿本身粘膜较薄，腺体分泌较多，分泌较多的腺体，但不会擤鼻涕，因此，分泌物过多会引起鼻塞，出现呼吸困难。
4.感染：感冒的新生儿会出现严重的鼻腔水肿。
新生儿呼吸重是肺部的呼吸功能没有发育完全有一定的关系。新生儿出现呼吸比较重的情况，不会有什么影响，不要太担心，只要在出生后进行一下呼吸监测，孩子可以正常呼吸，并且血氧饱和度正常就不会影响孩子健康的。
婴儿在呼吸时，若胸口波动较大，并出现呼吸粗大，极可能为肺部疾病，还有慢性肺炎的可能，在此期间，父母要观察婴儿呼吸症状，并要维持呼吸健康，勿使婴儿吸入刺激性气体。如果发现孩子有憋气的情况，就需要及时进行检查，并根据具体情况做出处理。
如在胸口波动较大时期出现胸闷，应及时到医院进行观察处理，并要弄清病因，对症施治。
一般引起新生儿呼吸快的原因首先是由于新生儿患有肺炎导致的，如果新生儿感染肺炎链球菌等细菌或者感染呼吸道合胞病毒等病毒，都可以引起新生儿发生肺炎，从而导致新生儿出现呼吸次数的增快。这是由于新生儿患有肺炎以后，肺泡出现病变，从而引起肺泡中的氧气交换能力，会引起体内的缺氧，缺氧状态以后会引起呼吸次数的代偿性增快。
新生儿呼吸中枢不稳定，呼吸器官不成熟，可能会出现一过性的呼吸增快或者呼吸节律的改变。需要看宝宝呼吸急促的持续的时间，如果仅仅是几秒钟对宝宝影响不大的，暂时观察就可以了。
新生儿吃奶时呼吸困难，这可能是由于感染导致的感冒。可能是细菌感染导致的，再有就是病毒感染引起的；还可能就是机体的抵抗力降低的原因。关键是对因治疗。做一下血常规、痰液的培养，明确致病微生物后，对因治疗。