三个月宝宝咳嗽、鼻塞可能是呼吸道感染导致的，具体分析如下：
三个月宝宝咳嗽、鼻塞，可以判断存在呼吸道感染。常见的有打喷嚏、发烧、咳嗽、流鼻涕等症状。建议带着孩子到医院检查一下血常规和炎症指标，看是不是病毒感染引起的，还是细菌感染引起的。如果是病毒感染，可以服用一些抗病毒的药物。如果是细菌感染，可以服用抗炎的药物。要注意肺部感染，要做胸部X光检查。
一般情况下，宝宝出现鼻塞咳嗽的话，大多数的原因都是得了呼吸道感染所导致的。
针对出现这类症状的宝宝，可以给孩子口服一些抗病毒的中成药来进行治疗，可以服用的药物包括小儿豉翘清热颗粒，安儿宁颗粒，百蕊颗粒，蒲地蓝消炎口服液等，治疗期间家长要注意给宝宝保暖，适量喝温热水，促进新陈代谢，有利于促进宝宝身体恢复。
宝宝出现咳嗽，鼻塞，常提示存在急性上呼吸道感染，由细菌和病毒混合感染所致，也可能存在肺炎支原体、衣原体等感染。当然，也和宝宝本身体质容易敏感，接触到外界容易引起过敏的物质所致。
有可能是过敏导致的，一般鼻塞就是过敏性鼻炎咳嗽在夜间比较明显的，一般和过敏性咳嗽有关，也就是变异性支气管哮喘。需要到医院给孩子做一下相关检查，然后使用相应的抗过敏药物进行治疗。
新生儿出现鼻塞咳嗽可能是呼吸道发生了感染，可能是上呼吸道或者下呼吸道感染。最可能是上呼吸道感染。也有可能患了风寒性的感冒。想要治疗，要给宝宝喂一些温热的食物，要保持室内空气的清新。
宝宝应该是着凉导致感冒发生。感冒即急性鼻炎，其主要症状是鼻塞、流涕、打喷嚏，可伴有发热、头痛等全身症状。一般多为病毒感染，后可合并细菌感染。因为宝宝太小，如果没有发热症状，可暂不使用抗病毒及抗炎药物，可多喝白开水，适当发汗。