一般情况下，矮小症有以下病因。
1、宫内发育迟缓：孕期低体重、严重呕吐、严重感染等原因容易导致营养不良，从而出现矮小症的情况。
2、内分泌激素分泌异常：生长激素缺乏、糖皮质激素过多、甲状腺功能减退等原因容易引起内分泌激素分泌异常，从而出现矮小症的情况。
3、染色体异常：矮小症还可能是染色体异常引起的，这通常与染色体遗传性疾病有关。
4、慢性系统性疾病：患有先天性心脏病、慢性肝炎、肾小管酸中毒、慢性肾炎、肠道功能紊乱等疾病也可能引起矮小症的发生。
5、骨和软骨发育不良：骨和软骨发育不良通常也有可能导致矮小症。
矮小症的小孩早期症状可能有身材矮小、生长缓慢、比例异常等，由于存在个体差异性，具体情况因人而异。
矮小症是一种生长发育障碍性疾病，通常是遗传、近亲结婚等因素导致的染色体异常。由于缺乏生长激素，矮小症的小孩通常会比同龄人矮小，身高上与同龄人有较大的差距；矮小症的小孩如果生长激素分泌不足，可能会造成生长缓慢。矮小症的小孩通常是躯干和头颅相似，而四肢远远小于常人，可能会表现为头大、手短、腿短等，造成比例异常。
矮小症的小孩在日常生活中应注意饮食摄入均衡，适量吃高蛋白、高维生素的食物，如蛋类、豆类、奶类等，可以在医生的帮助下通过经额开颅手术、经鼻蝶微创术等方式进行治疗。
矮小症是由生长激素缺乏、甲状腺功能低下、肾功能不全、特纳综合症、先天性软骨发育不良、营养不良、垂体发育不良等原因引起的。还有就是特发性矮小、家族性矮小、青春期体质发育延迟等。矮小症是由遗传因素、长期营养不良、基因突变、骨骼发育迟缓等多种原因引起的，主要是遗传疾病、遗传疾病、基因突变、骨骼发育迟缓等。
垂体性矮小症的主要临床症状如下：
身体发育缓慢，但并未完全停止生长，一年的身高不到4~5cm，到成人期130cm以下，骨龄推迟2年，长骨和骨骺融合比较晚，有些病人的牙齿发育比较迟。单纯性生长激素不足的人，一般在20岁左右才会出现青春期、第二性征的发育。垂体性矮小患者的智商与其年龄相当，其学业表现与其同龄人无明显差异。继发矮小症，除了缺乏生长激素的症状外，还会出现由下丘脑垂体肿瘤引起的原发征象。
矮小症早期身高比较矮，体格比较小，如果在相似环境下，同种族、同性别、同年龄病者身高低于正常人群平均身高两个标准差以上或第三百分位以下，就能诊断为矮小症了。
矮小症的早期症状如下：
矮小症的早期表现是1岁后生长速度减缓。1岁以后，生长速度会变慢，生长滞后甚至会加重，身高低于同性别的同性孩子的生长曲线低于30分位，身高年增长速率小于4cm，智力发育也是正常的。孩子的头部圆圆的，五官稚嫩，脸型圆润，皮肤细腻，头发稀疏，下巴和颏部发育不全，牙齿发育迟缓，排列不规则，孩子虽然发育迟缓，但身体各部分的比例都很均匀，符合孩子的实际年龄。