如果女性有阴道毛滴虫感染的情况，可以在医生的指导下用甲硝唑进行治疗。不过感染阴道毛滴虫以后，会诱发滴虫性阴道炎，因此在治疗方面，女性还可以采用抗滴虫的药物进行治疗。由于滴虫性阴道炎会同时伴随泌尿系感染的情况，因此建议女性需要全身用药治疗。最常用的两种药物包括甲硝唑和替硝唑，这两种药物的治疗效果比较明显。建议女性用药期间禁止饮酒，禁止同房，另外，哺乳期用药也不宜哺乳。
身体患有滴虫感染引起的阴道炎等疾病，应该及时选择服用抗生素进行抗炎治疗，应该先治疗好疾病，再进行备孕，如果在炎症期间进行性行为，没有采取避孕措施的话，当然也有受孕的可能的。
阴道毛滴虫感染所导致的疾病称为滴虫性阴道炎，也是常见的性传播疾病。滴虫性阴道炎病人可同时存在尿道，尿道旁腺，前庭大腺多部位滴虫感染，治好此病需全身用药，并避免阴道冲洗。
这种疾病交叉感染的可能性较大，通常是因为性生活中感染的可能性较大，所以一旦出现，就必须积极改进治疗。通常，治疗期间必须禁止性生活。避免交叉感染。夫妇双方同时接受治疗，治疗期间禁性生活，内裤毛巾煮沸消毒，服药期间忌酒，滴虫转阴后，连续3次检查滴虫均为阴性。
女性在备孕期间如果有阴道炎的情况，阴道炎治疗好后再考虑怀孕。如果有阴道炎的情况会影响受孕困难，而且即使怀孕了也容易增加先兆性流产的几率。怀孕期间治疗受药物限制，所以需要治疗好后再考虑受孕，治疗三个疗程，白带常规转阴，并且夫妻同治以免引起交叉感染。