卵巢囊肿手术属于妇科手术，其性质一般可分良性、恶性和交界性，该手术大不大，还要根据具体问题进行分析。如果是单纯良性的卵巢囊肿手术，这种手术伤口较小，手术算小的，愈合较快，并不是比较大的手术。如果是卵巢囊肿是交界性的或者是恶性的，可能要根据肿瘤范围的大小进行附件切除术或者是卵巢肿瘤的减灭术，这种情况就属于比较大的手术，因为范围比较大。
通常来说，卵巢囊肿手术是小手术。具体分析如下：
卵巢囊肿的手术从一般意义上来讲，应该算是小手术。卵巢囊肿的手术目前可分为单纯的囊肿剔除术和附件切除术，这两种手术都可以通过腹腔镜的方式进行。手术创伤很小，患者术后恢复较快，手术疤痕也比较小，外形比较美观。手术需要在全麻下进行，对麻醉药耐受力较差的患者，可能会出现术后呕吐，但一般会在术后24h内恢复正常。
如果卵巢囊肿选择微创手术，在三甲级别的医院做，一旦用腹腔镜，费用至少20000元以上，一般是20000-30000元之间。以下为常见一般公立医院收费参考：卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即一侧性或双侧性、囊性或实性、良性或恶性，其中以囊性多见，有一定的恶性比例。卵巢囊肿类型不同、治疗方法不同，手术难易程度和术后辅助治疗也存在不同。良性卵巢囊肿治疗费用约几千到一两万块钱不等；恶性或交界性肿瘤，手术范围较大，术后需辅助化疗等治疗方式，费用较高。
一般来说，如果是单纯的卵巢囊肿，需要做腹腔镜手术，一般在术后3个月左右就能准备怀孕。
但是，如果是卵巢巧克力囊肿，可以通过肌肉注射曲普瑞林等药物来控制巧克力囊肿的复发，但是这种情况下一般要半年后才能怀孕。而且服用曲普瑞林后，会有假绝经，短时间内可能也无法怀孕。患者备孕期间可以服用叶酸，养成良好的作息习惯。
卵巢切除手术，这应该是可以治疗好的，手术是彻底治疗卵巢囊肿的方法，药物治疗一般只有控制才能彻底治疗。大多数人不会复发，当然也有少数人会复发，所以术后定期检查，注意休息，保持好心情。
通常情况下，卵巢囊肿手术可能会影响怀孕，也可能不会。具体分析如下：
卵巢囊肿手术是否影响生育与囊肿的大小以及手术方式有很大的关系。如果是单纯的良性囊肿，并且不大，通常不会影响患者怀孕。但是如果卵巢囊肿较大，在做手术时可能就会损伤到周围组织，如输卵管，子宫等，所以这种手术可能会影响怀孕。有时处理恶性的卵巢囊肿，可能会把同侧的附件也同时切除，那么就会导致怀孕的概率降低。