如果是结石引起的肾积水，需要给予排石治疗，比较常用的排石方法有应用排石药物、体外冲击波碎石、经皮肾镜取石术以及手术等治疗方法。如果是肾盂、输尿管连接处狭窄引起的肾积水，也需要给予手术治疗。
肾积水的治疗大多数人不用治疗，可完全治愈。而由泌尿系感染引起的肾盂积水，多建议应用抗生素治疗，建议行中段尿微生物培养、泌尿系彩超、泌尿系CT等相关检查，治疗疗程一般为2周，为复杂性尿路感染。待感染控制稳定以后，肾积水也可以自行消失。如为梗阻引起的肾积水，明确是结石还是肿瘤压迫引起的，大多数解除梗阻后，肾积水可以消失。
U100钕激光碎石，它通过仪器发出红绿两种波长的脉冲激光，精准定位结石后，安全高效地击碎结石，取石篮自动跟进取石并冲洗；体外冲击波碎石治疗，体外冲击波碎石，是利用体外冲击波聚焦后击碎体内的结石，使之随尿液排出体外。优点是不需麻醉、不需手术。
肾积水是十分常见的一种疾病，肾积水主要是存在有输尿管梗阻或者其他的尿路梗阻。输尿管梗阻常见的原因是输尿管狭窄或者输尿管结石，引起肾脏积水。肾积水治疗的关键是及时解除梗阻，如果是输尿管狭窄引起的肾脏积水，通常可以行输尿管切除断端吻合手术，只要将狭窄段去除，就会使肾积水缓解。
通常情况下，孕期右肾积水可以通过药物、手术治疗。
孕期右肾积水，如果明显的有肾绞痛的表现，可以注入硫酸镁针剂、间苯三酚针剂、黄体酮针剂缓解疼痛，并且不危害胎宝宝。与此同时，在局麻下开展输尿管置管手术治疗，将积水注入肾脏功能，可以有效的维护肾脏功能，直到不必出生后，可以进一步查验积水的缘故。如果是尿结石造成的，可以选择体外碎石、内镜下的激光碎石处理结石。
左肾积水要根据积水的多少判断，若是刚发现，肾盂不明显可以暂时不处理，观察肾积水的情况即可。
若病情进展，肾实质受压明显，要尽快手术处理，若没有明显变化，可以继续观察，手术治疗肾积水的进展也不能保证，肾盂扩张能否完全恢复。肾积水量较大时，肾实质受压较明显，要尽快手术治疗保证肾功能，若巨大肾区合并感染，要根据左肾情况判断，轻度的感染可以尽早手术，有脓肾、肾功能丧失的情况左侧肾可能需要切除。
