甲状腺囊肿多为良性。甲状腺癌合并囊肿少见，约1%~2%，癌性囊肿、囊液细胞学检查通常可见癌细胞。曾用手术治疗甲状腺囊肿，多切除囊肿。
手术操作造成的骨肿瘤疤痕，影响美观，有一定的并发症。目前多主张穿刺抽取和注射硬化剂治疗。这些固化剂能使囊壁发生无菌性坏死，阻止囊肿生成，使囊壁粘连，达到治疗纤维化、囊肿堵塞、囊肿的目的。该治疗对薄壁囊肿效果最好，有效率达94%。厚壁囊肿疗效差。厚壁囊肿实变肿块与周围组织无明显边界，囊肿内容物血性，反复抽吸后快速积聚，应警惕癌变可能，宜采用手术治疗。术中病理活检为恶性肿瘤，按甲状腺癌处理。
目前甲状腺囊肿出血的唯一有效治疗方法是甲状腺的手术治疗，其他方法一般无效。
甲状腺囊肿出血一般为良性病变，患者无需过于紧张和担心，只要经过规范的手术治疗即可治愈。患者经过手术后，可能需要长期或终生口服左甲状腺激素片进行替代治疗。另外，还需要补充适量的钙片和维生素d，以防止低钙血症的发生。患者进行手术后，必须保持切口敷料干燥，勤伤口换药。如果患者有糖尿病，必须控制血糖。
有时在做B超的时候，会发现有一个囊肿，患者会很紧张，不知道会不会有危险，需要对囊肿进行进一步的观察，最好的方法是三个月复查。同时还要检查囊肿是否大，是否有压迫感。比如说，压迫到了甲状腺组织，压迫到了颈部的血管，患者会感觉到不适，如果囊肿生长的太快，就必须要做手术，如果囊肿向外生长，形成一个包在脖子上，会很影响美观。有些特殊的职业，可能会选择外科。同时还要检查囊肿边缘有没有毛刺，里面有没有钙化。
根据患者甲状腺多发性囊肿的体积、大小，根据囊肿的具体性质和患者是否伴有明显临床症状等因素，往往采取不同的处理方法。具体如下：
一、甲状腺多发囊肿体积相对较小时，囊肿没有压迫局部神经血管或重要脏器。可定期行甲状腺彩超检查，仔细观察囊肿变化情况，建议患者暂时无需特殊处理。
二、甲状腺多发囊肿体积大，压迫至患者喉返神经、气管、食管，患者出现一定程度的声嘶、呼吸困难，此时多发性囊肿病情较严重，建议患者及时治疗手术。
对于甲状腺病的治疗一定要选择正规医院，以免由于治疗不规范以及服务不周等原因，造成不必要的损害。初期是治疗甲状腺结节的好的时期，采用科学方法治疗甲状腺结节是可以及时治疗的。早期甲状腺结节不是很重，更重要的是致病因对身体的影响还比较小，容易查找和清除。具体的治疗方案需要结合每个人的详细情况，来选择适合德病情的治疗方案，才会有明显效果。
