多数先天性肾积水经过适当的治疗，是存在治愈的情况的。
先天性肾积水属于先天性发育不正常，需要积极配合手术治疗，是有机会治疗痊愈的。肾积水是由于泌尿系统阻塞导致肾盂和肾盏扩张，尿液潴留。由于肾内尿液积聚，压力升高，肾盂及肾盏扩大，肾实质萎缩。肾盂输尿管交界处梗阻是肾积水的主要原因。建议日常家长多以清淡饮食为主，通过母乳喂养的婴儿可以有效帮助病情的恢复，避免食用过于刺激的食物。
肾积水的临床主要症状有结石疼痛、肿瘤血尿、尿道狭窄、排尿困难等。水的侧面在腰部膨大。复杂的感染包括寒战、发烧和脓尿。腰部囊性肿块在患侧。双侧慢性肾功能不全梗阻，尿毒症。腰痛腰囊性肿块。肾体积增大，皮质变薄，实质液暗区。X光静脉尿路造影显示肾积水。
先天性肾积水不能自愈。一侧肾积水，另一侧肾功能会明显变强，能满足机体需要，如果双侧先天性肾积水，血肌酐明显升高，要进行输尿管的支架术或者输尿管的手术，改善输尿管狭窄，防止肾功能受损。
治疗主要得根据输尿管狭窄段的长短，以及狭窄的病因来治疗。如果输尿管的狭窄段很短，不超过2cm，比如肾盂输尿管连接部先天性狭窄，或者输尿管的膀胱入口处，因为各种原因导致的狭窄，狭窄段如果不超过2cm，可以进行腹腔镜下微创手术。
微创外科术后出现的肾积水与阻塞的持续时间和阻塞的严重程度有关。
如果是中等程度的肾结石，在做了微创外科的时候，也会出现肾积水，这是一种不可逆的伤害，严重的肾盂会被撕裂，失去了组织的弹性和修补能力。对于肾结石来说，最好的办法就是尽早进行微创手术，这样可以使肾的机能得到恢复，并减轻水肿的严重。注意规律饮食，避免辛辣刺激等食物，如辣椒、咖啡等。注意饮食不宜过于精细，饮食中配以粗纤维食物，如芹菜、油菜等蔬菜。
肾积水会造成尿路感染、肾萎缩、结石形成、巨大肾积水、引起全身中毒、肾脏剧烈疼痛、引发高血压。长时间的肾积水得不到缓解就会发生感染症状，感染之后有脓尿和全身中毒的症状，这时候就像炎症一样会身体发热，头痛是难免的，胃肠功能紊乱也会发生，比如恶心呕吐，还可能引起结石出现，结石还会阻塞尿道并发肾积水，肾积水又诱发结石形成，肾积水得不到缓解，这两种疾病就会交替出现。这样也会引起反复的尿液感染，让肾结石的病情更加严重。建议及早到医院检查对症治疗，日常可以多吃黑木耳。黑木耳含有多种矿物质，能对各种结石产生强烈的化学反应，剥脱、分化、侵蚀结石，使结石缩小，排出。