右侧肾囊肿会引起腰疼。比较小的囊肿在检查时容易发现，极少数可能会因为囊肿破裂出现肉眼血尿、尿常规检查有潜血等表现，任何症状的，都可以不用做任何的处理，定期做彩超复查，随访观察即可。
肾囊肿是成年人肾脏最常见的一种结构异常，可以为单侧或双侧，一个或多个，直径一般2cm左右，也有直径达10cm的囊肿，多发于男性。出现的腰部疼痛，可能和肾囊肿有直接的关系。如果囊肿较小，一般不需做什么特殊的治疗，如果肾囊肿超过5厘米，甚至是10厘米，对局部产生压迫症状，应该进行硬化或手术治疗。
肾囊肿如果明显长大，出现腰痛症状，可以通过手术治疗，切除囊肿，定期复查，防止复发。肾脏囊肿在比较小的情况下并不会引起腰痛的。只有囊肿体积出现了明显增大的时候才会出现腰痛的感受。要去医院检查一下，看一下囊肿有多大，如果比较大是需要进行手术治疗的。
腰间盘突出可能会压迫肚子疼，但比较少。
腰椎间盘突出的病因有可能是由于年纪大了，腰椎的退行性病变，也有可能是由于创伤引起的纤维环破裂，髓核突出或脱离椎管，挤压脊髓神经根和硬膜囊，从而引起的一系列临床症状。通常表现为坐骨神经上的疼痛、麻木。此外，椎间盘的突起会产生炎症的代谢物，会引起腰侧的疼痛，一般这种疼痛很难波及到肚子。所以，如果出现肚子疼的症状，建议患者一定要去普外检查，以确定是否有腹腔器官疾病。
腰疼引起肚子疼的原因如下：
腰椎间盘突出、椎管狭窄、腰肌劳损等腰部疾病，一般不会引起腹部疼痛，但是腰椎压缩性骨折容易引起腹膜后出血，引发腹胀、腹肌紧张、压痛、反跳痛等症状。这类患者如果伴有非常严重的椎管狭窄和椎间盘突出，在用力排便时会加剧患者的临床表现，使患者不能排便，导致便秘，进而会引起下腹部的疼痛。还有就是急性阑尾炎、肾炎、肾盂肾炎、泌尿系结石、胰腺炎等外科疾病，都会引起腰痛，早期主要表现为腹部的不适。
腰间盘突出总是腰疼可通过以下方式进行处理：
第一、短期佩戴腰部护具，可以帮助腰部承受重量，减轻腰椎的压力，从而减轻腰部的酸痛；还可以通过服用美洛昔康等镇痛药来缓解疼痛。
第二，如果疼痛反复出现，要做进行体格检查和CT、MRI等方面的评估，如果达到了外科手术的要求，就需要立即进行外科治疗。去除腰椎间盘突出病变，消除神经压力，从根本上解决腰椎时常痛的问题。在此基础上，要加强对脊柱的稳定性的维护，防止术后出现腰椎滑脱，造成神经再次受压。