一般情况下，桥本甲状腺炎甲减主要通过服用左甲状腺素治疗。
桥本甲状腺炎是一种自身免疫性疾病，目前并没有研发出针对病因治疗的药物，主要是支持和对症治疗，保持甲状腺的功能，控制并发症，限制碘盐摄入可能有助于减缓甲状腺组织的破坏。
当出现甲状腺功能减退时，可以给予左甲状腺素治疗，可以改善甲状腺激素的缺乏。
桥本氏甲减，目前无针对病因的治疗措施。只是根据血清促甲状腺素水平升高者，无论是亚临床甲减或者是临床甲减，均给予甲状腺素替代治疗。一般的采用左甲状腺素钠片，剂量视病情而定，小剂量开始，逐渐加量，需终身服药。
一般是因为免疫性的原因导致的，不需要特别治疗的，但是如果说出现这个甲减情况下，那么可以使用一些甲状腺素片的。平时在饮食上面需要注意，忌辛辣刺激性食物，多喝水，避免受凉。
单纯的甲减更严重。桥本氏甲减称为自身免疫性甲状腺炎，在医学病例史上，桥本氏甲减大约占甲状腺疾病1/5，病因较为隐性，大多不易被人察觉，发展较为缓慢。常表现为呼吸困难、声音嘶哑、颈部有压迫感，不能笼统的说桥本氏甲减是甲减，它只是甲减类型中的一种。而且是较为轻微的症状，单纯的甲减会更严重。建议饮食方面要注意营养，多食以维生素、高蛋白质为主的食物，尽量少食或不食寒性生冷物，坚持适度的锻炼，动静结合，效果更佳。
桥本氏的甲减，很有可能是遗传性的，如果一对夫妇中的一人，或是两人同时患上了桥本甲状腺炎，那么他们的后代就会出现桥本甲亢。
桥本甲亢，是一种发展的趋势，桥本甲亢的病人，大部分都会因为病情的恶化，出现甲减。如果出现甲减，变成终身甲减，终身都要进行手术，不过也有少数人可以长期维持自身的甲状腺机能，只是不会因为甲状腺增高而导致的抗体不会完全消除。