如果任其发展，最终脓肿将向肛周皮肤或肛管直肠腔内破溃形成肛瘘，如果脓液得到引流，症状可暂时缓解，随后破溃口可愈合，脓液又不断积聚，感染向周围继续扩散，再次出现症状，并可能出现新的脓肿，并形成多个破溃口，如此反复发作，经久不愈。及时到当地的正规公立医院肛肠科确诊，以免延误病情而贻误治疗时机。
治疗肛周脓肿治疗，一般是需要及时切开引流，排出脓液，并且定期进行换药处理，以观察伤口创面的愈合情况，后期可以在每次大便之后，使用消炎溶液坐浴，另外，肛周脓肿的病人需要酌情进行抗菌素治疗，可以根据病情给予口服、肌肉注射或者静脉滴注。
轻微肛周脓肿可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等，但多数需要手术治疗，还可以采用温水坐浴进行治疗，平时保持肛门清洁，注意卧床休息，多喝水保持大便通畅，注意饮食，多吃润肠通便的食物。
婴儿肛周脓肿的治疗方式如下：
小儿肛周脓肿的治疗要看病情的严重程度，进行针对性治疗。首先，可以用抗生素来控制感染，在家里用温水坐浴。如果形成脓肿，需要切开引流。开始会出现皮肤红肿硬结，然后会变软，会有波动感，还有一些孩子会出现高烧、呕吐等症状。肛周感染是由肛周软组织引起的急性化脓性感染导致的，这是一种很特殊的疾病，一般是由肛门部位的皮炎、疖肿、粗糙的尿布划破肛周组织，或者是感染引起的周围脓肿。
肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性感染性疾病是一种细菌感染，容易发展为肛瘘的。发病率约为2%，占肛肠疾病的8%～25%。多见于20～40岁的男性，男性发病率是女性的3～4倍，小儿发病率也相对较高。早期如果积极的手术治疗，绝大部分肛管直肠周围脓肿可获得治辽。也有一些存在反复发作可能。极少数因感染过重，有严重后果的可能性。