灰指甲的出现与甲下真菌感染有关，其中红色毛癣菌、石膏样毛癣菌等皮肤癣菌为灰指甲的主要致病菌。因此，患者可以选用能够有效杀灭真菌的抗真菌感染的药物进行治疗。
常见的抗真菌感染药物多为外用搽剂，如亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，该药物能够渗透甲下，作用于患处真菌，达到持续杀菌的功效。在用药期间，需按照说明书或医生指导严格使用。建议患者坚持长期规范用药治疗，有助于达到更好的治疗效果。用药期间，注意调整个人生活、卫生习惯，可帮助药效得以发挥。
及时的到正规医院接受治疗，买一些药物配合治疗，不要拖延病情，平时要养成良好的卫生习惯，勤洗手、勤洗脚。不要美甲，以免伤害指甲，导致灰指甲的真菌感染。不要吃太辛辣的东西。
灰指甲用抗真菌药最有效。灰指甲也就是甲癣，是真菌感染引起的，大多数灰指甲患者因为脚上的真菌扩散到指甲根部引起的，所以出现灰指甲的话一定要积极治疗脚气。灰指甲通常是口服药物，按着说明书的冲击疗法吃，也就是每日早两粒晚两粒，吃一周停三周是一个疗程，手上的灰指甲吃两个疗程，脚上的吃三个疗程。如果这个药对肝脏有一定影响，肝功异常或是抗拒吃口服药的话可以外用亮甲，这个药也得用2到3个月才能见效。见效以后原先的灰指甲不会变回来，但是新长出来的指甲是正常的，大约半年就会完全恢复正常。建议根据医生的医嘱用药。适当放松脚步，不穿不透气的鞋，注意补充高蛋白饮食，平常可以多吃点燕麦片和豆制品之类。
主要是由于脚气或者手癣传染导致目前主要使用药物进行治疗，可以使用特比萘芬乳膏外用治疗，应该坚持治疗一个阶段局部的症状，消失后再巩固治疗1~2周的时间基本可以治疗。另外平时也可以使用花椒水泡脚，也能够有效的预防和治疗真菌感染，还应该穿疏松透气的鞋子，这样有利于脚的健康。此病会导致传染，一旦确诊需要注意卫生，切断传染源，用过的物品必须严密消毒，需要通过中西药结合的方法，配合刮甲以及封包的方法。
注意卫生，切断传染源，用过物品必须严密消毒，因为指甲太厚药物不好吸收，可以采取塑料薄膜封包治疗，配合口服治疗皮肤深处和浅表都有杀灭能力的药物。可以更好改善灰指甲症状。