肛瘘的治疗目标是尽可能减少括约肌损伤，消除肛瘘内口和任何相通的上皮化瘘管。手术治疗原则是将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织同时切除，使伤口自基底向上逐渐愈合。根据瘘管深浅、曲直，可选用挂线疗法、肛瘘切开或切除术。少数可行肛瘘切除后一期缝合或游离植皮。
隐睾位置会严重影响睾丸发育，位置越高发育就越差，尤其是在腹股沟以上位置的隐睾，需要尽早做手术，否则很可能会影响孩子未来的生育功能等。隐睾如果不治疗，或者治疗不及时，成年后发生睾丸癌的几率比正常人高100倍左右。国外的文献显示，超过7岁再做隐睾手术，对预防睾丸癌几乎就没有作用了。
咳嗽是由于上呼吸道感染，病毒性感冒引起的，会导致咽喉部肿胀，咳嗽咳痰，声门水肿而引起嗓子变声，可以进行雾化稀释痰液，促进痰液排出，口服一些化痰止咳的药物进行治疗。
可以考虑局部做一下热敷或者适当的按摩，针灸，拔罐都是可以的，这些具体的治疗方式都有利于症状的消失。落枕，其主要原因是由于颈椎的相关部位的肌肉出现了痉挛的可能性比较大，是由于受凉引起的。
可以服用抗生素抗感染治疗，然后局部涂抹乳膏，每次排便后用温水清洗肛门，保持肛周的局部清洁，但是如果肛瘘反复发作，瘘口比较多，形成了复杂性肛瘘，使用保守的治疗方法效果不好，要选择手术治疗，主要是手术切开引流。